RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-205	ENST00000577827	FGF4	P08620	206 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CDKL1	Q00532	357 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GRB7	Q14451	532 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC15A4	Q8N697	577 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	MZB1	Q8WU39	189 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	IL12RB2	Q99665	862 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PRMT3	O60678	531 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ASGR1	P07306	291 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC5A2	P31639	672 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	WNT7B	P56706	349 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SKP1	P63208	163 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	DUSP4	Q13115	394 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	FBXL22	Q6P050	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	C1orf74	Q96LT6	269 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	FRMD6	Q96NE9	622 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	MND1	Q9BWT6	205 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	EBPL	Q9BY08	206 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GIMAP2	Q9UG22	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	DPP7	Q9UHL4	492 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	FZD4	Q9ULV1	537 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PADI3	Q9ULW8	664 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	TJP1	Q07157	1748 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC1A7	O00341	560 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PTTG1	O95997	202 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SMPD1	P17405	629 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GPR1	P46091	355 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CES5A	Q6NT32	575 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GPR152	Q8TDT2	470 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	KCNC2	Q96PR1	638 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	NUP98	P52948	1817 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827		A0A096LPI6	279 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	DLGAP1	O14490	977 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	WNT9A	O14904	365 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	S1PR4	O95977	384 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	POU2F1	P14859	743 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PRKACG	P22612	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	HSF2	Q03933	536 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SCARB2	Q14108	478 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	MPPE1	Q53F39	396 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CCDC157	Q569K6	752 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	NEK6	Q9HC98	313 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	DHRS7	Q9Y394	339 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827		J3KR12	359 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PRAMEF10	O60809	474 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	GNG2	P59768	71 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CYP4F8	P98187	520 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PTPRM-205	ENST00000577827	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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