RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 SIX5Q8N196 739 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF480Q8WV37 535 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4K3Q96R72 315 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ELOVL6Q9H5J4 265 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 RMI1Q9H9A7 625 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRTM1Q9HBL6 345 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC23A2Q9UGH3 650 aa27.6■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAN2B1O00754 1011 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANGPT2O15123 496 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFLARO15519 480 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 PDYNP01213 254 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ME2P23368 584 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNK10P57789 538 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 DMPKQ09013 629 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 EOGTQ5NDL2 527 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYP20A1Q6UW02 462 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 SELENOMQ8WWX9 145 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM3CQ92520 227 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACTL8Q9H568 366 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf109Q9NX04 203 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa27.59■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 KRBA1A5PL33 1030 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 EEDO75530 441 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 G6PDP11413 515 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC2A4P14672 509 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 JAK1P23458 1154 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 IRF8Q02556 426 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKG2Q13237 762 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCNIQ14094 377 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 RCN1Q15293 331 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 FRG2Q64ET8 278 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 MINDY1Q8N5J2 469 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFCAB3Q8N7B9 438 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 SHDQ96IW2 340 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 MRGPRX1Q96LB2 322 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 FRG2BQ96QU4 278 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 SGPP1Q9BX95 441 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACPTQ9BZG2 426 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 SPAG4Q9NPE6 437 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR1A2Q9Y585 309 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A0C4DFX4 3053 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 DOCK9Q9BZ29 2069 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD72P21854 359 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 HNF4AP41235 474 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 HALP42357 657 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 HMGCS1Q01581 520 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 FOXM1Q08050 763 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 CCINQ13939 588 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 KIAA0040Q15053 153 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 IMPG1Q17R60 797 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRMT9Q6P2P2 845 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF852Q6ZMS4 543 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM181Q9P2C4 612 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKAB1Q9Y478 270 aa27.58■■■□□ 2.01
CTDNEP1-210ENST00000574322 E7ENX8 843 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 H0Y3Z8 333 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM38O00635 465 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACPPP15309 386 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL12AP29459 219 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPL38P63173 70 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SGO1Q5FBB7 561 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 GRHL2Q6ISB3 625 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 EDAQ92838 391 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSBPL6Q9BZF3 934 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 EBF2Q9HAK2 575 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 GID8Q9NWU2 228 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa27.57■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3EA0A087X179 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3LB9A6J9 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 H0YIV9 168 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLGNO14967 610 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3HP0C7X1 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD22P20273 847 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGFALSP35858 605 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLK6Q92876 244 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 WDR34Q96EX3 536 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 MED8Q96G25 268 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 CD300AQ9UGN4 299 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 BCAP29Q9UHQ4 241 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNE2Q9Y6J6 123 aa27.56■■■□□ 2
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNJ13O60928 360 aa27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms