RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 LRTM1Q9HBL6 345 aa28.25■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASIC5Q9NY37 505 aa28.25■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GRHL2Q6ISB3 625 aa28.24■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf109Q9NX04 203 aa28.24■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NPIPB8E9PQR5 432 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM234BA2RU67 622 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC22BO75396 215 aa28.23■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC52A3Q9NQ40 469 aa28.21■■■□□ 2.11
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF839A8K0R7 811 aa28.21■■■□□ 2.11
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOSL2P15408 326 aa28.21■■■□□ 2.11
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