RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	MED26	O95402	600 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	EDN3	P14138	238 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	PRF1	P14222	555 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CD9	P21926	228 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	OR1D4	P47884	311 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ARSF	P54793	590 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC16	Q13042	620 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SEMA3A	Q14563	771 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	P3H1	Q32P28	736 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	FAR1	Q8WVX9	515 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	HDAC10	Q969S8	669 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LHPP	Q9H008	270 aa		12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	F8	P00451	2351 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	IQCF5	A8MTL0	148 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	NRP2	O60462	931 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CTSV	O60911	334 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	GPC4	O75487	556 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	KLHL18	O94889	574 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	GRM7	Q14831	915 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	RBBP7	Q16576	425 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF534	Q76KX8	674 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	MARVELD3	Q96A59	401 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF778	Q96MU6	729 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		12.04	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	FITM1	A5D6W6	292 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	RASGRF2	O14827	1237 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	PRICKLE3	O43900	615 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	S1PR4	O95977	384 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMB5	P28074	263 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	CETN2	P41208	172 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	GRIA1	P42261	906 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	PER3	P56645	1201 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ACVR1	Q04771	509 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	MFAP5	Q13361	173 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	TLR1	Q15399	786 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	TCTE1	Q5JU00	501 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00523	Q86TU6	105 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	FJX1	Q86VR8	437 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC34A3	Q8N130	599 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT222	Q8N1A0	295 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	COG1	Q8WTW3	980 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	ASZ1	Q8WWH4	475 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	TSPY26P	Q9H489	355 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms