RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 LCP2Q13094 533 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PRKG2Q13237 762 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 STX3Q13277 289 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 LAPTM5Q13571 262 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 GPR18Q14330 331 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 NR1D2Q14995 579 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 LCTLQ6UWM7 567 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OOSP2Q86WS3 158 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 OR10G6Q8NH81 332 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 MGARPQ8TDB4 240 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZNF480Q8WV37 535 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 UBE2E3Q969T4 207 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ZBTB9Q96C00 473 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PHF21BQ96EK2 531 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CDC6Q99741 560 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SGPP1Q9BX95 441 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 DRC3Q9H069 523 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 RAB33BQ9H082 229 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 EHD1Q9H4M9 534 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 IKZF3Q9UKT9 509 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 PADI4Q9UM07 663 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
CS-220ENST00000550700 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 WDR47O94967 919 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HSPA4LO95757 839 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EML2O95834 649 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GP1BAP07359 652 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CKMT1AP12532 417 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 AMD1P17707 334 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GSTM2P28161 218 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CMPK1P30085 196 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SERPINB1P30740 379 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NAGLUP54802 743 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RELAQ04206 551 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CLCQ05315 142 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SPEM2Q0P670 501 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CDC16Q13042 620 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ILKQ13418 452 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SQSTM1Q13501 440 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NAE1Q13564 534 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GTF2H2Q13888 395 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 RCN2Q14257 317 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GRB7Q14451 532 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CHI3L2Q15782 390 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 TBCCQ15814 346 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PTCHD3Q3KNS1 767 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PAGE2BQ5JRK9 111 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 LIPJQ5W064 366 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 MDM1Q8TC05 714 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 REPS1Q96D71 796 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 FAR2Q96K12 515 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 APOLD1Q96LR9 279 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CD180Q99467 661 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 CCT7Q99832 543 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 NTMT1Q9BV86 223 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.02□□□□□ -0.97
CS-220ENST00000550700 LRIT1Q9P2V4 623 aa9.02□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms