RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GOLGA8KD6RF30 607 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CATP04040 527 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CBSLP0DN79 551 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 NR1D1P20393 614 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CBSP35520 551 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 HSD17B2P37059 387 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CHAF1BQ13112 559 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PPP1R7Q15435 360 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CPZQ66K79 652 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CILP2Q8IUL8 1156 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ZBTB2Q8N680 514 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 LINC01555Q8NAE3 123 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PTERQ96BW5 349 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GBP5Q96PP8 586 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 TRIM55Q9BYV6 548 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GPR83Q9NYM4 423 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 MED13Q9UHV7 2174 aa16.26■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 TENM4Q6N022 2769 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 A0A1B0GX78 115 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 TTLL8A6PVC2 850 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ZNF185O15231 689 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 AVILO75366 819 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ALPPP05187 535 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CAPN1P07384 714 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ERVK-10P10266 1014 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ITGAXP20702 1163 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CMPK1P30085 196 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 BDKRB1P46663 353 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GABRA4P48169 554 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 FNTAP49354 379 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 FOXK1P85037 733 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CYP2A13Q16696 494 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CTSL3PQ5NE16 218 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 OR2Y1Q8NGV0 311 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 MS4A14Q96JA4 679 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 BIRC8Q96P09 236 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 COMMD10Q9Y6G5 202 aa16.25■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 A6NL46 340 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GOLGA8MH3BSY2 632 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PHF2O75151 1096 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 NIPSNAP2O75323 286 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 VPS26AO75436 327 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 USP1O94782 785 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CCNDBP1O95273 360 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ARNTP27540 789 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ATP1A4Q13733 1029 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CYP1B1Q16678 543 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 LONRF1Q17RB8 773 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PCGF5Q86SE9 256 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PPIL6Q8IXY8 311 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 OR9A1PQ8NGU1 263 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 HMGCLL1Q8TB92 370 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 SMPDL3AQ92484 453 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 NACC2Q96BF6 587 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 MIPEPQ99797 713 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CUTCQ9NTM9 273 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 NFS1Q9Y697 457 aa16.24■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 PCM1Q15154 2024 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 CES2O00748 559 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 DSCR3O14972 297 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 VPS4BO75351 444 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ALBP02768 609 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GRIA3P42263 894 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 GRB7Q14451 532 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 SLC9A5Q14940 896 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ARHGAP19Q14CB8 494 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 KLHL38Q2WGJ6 581 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD22Q5VYY1 191 aa16.23■□□□□ 0.19
CASP9-211ENST00000546969 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms