RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544253.1

ANKRD49-208, Transcript of ankyrin repeat domain 49, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD49, Length 3,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD49-208ENST00000544253 PER3P56645 1201 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SARNPP82979 210 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CHAF1BQ13112 559 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 RPS6KA1Q15418 735 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ATG9BQ674R7 924 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM205Q6UW68 189 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 KIAA1328Q86T90 577 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 HOOK3Q86VS8 718 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 LINC01555Q8NAE3 123 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CLEC1AQ8NC01 280 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 OR4E2Q8NGC2 313 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 RUNDC3BQ96NL0 473 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 NDNQ99608 321 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SLX1AQ9BQ83 275 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 NAT9Q9BTE0 207 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PHACTR1Q9C0D0 580 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 GFYI3L273 518 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 BMP10O95393 424 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 MYBL2P10244 700 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ICAM2P13598 275 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ERV3-1Q14264 604 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 KCNAB1Q14722 419 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC9A5Q14940 896 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 C4orf17Q53FE4 359 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TTC23LQ6PF05 361 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TMEM135Q86UB9 458 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PAQR7Q86WK9 346 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 GALNT16Q8N428 558 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CALML6Q8TD86 181 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 LRRN4Q8WUT4 740 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PBKQ96KB5 322 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 BIRC8Q96P09 236 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 NUDT9Q9BW91 350 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 LHPPQ9H008 270 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ETNK1Q9HBU6 452 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ARFGAP3Q9NP61 516 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 COPG2Q9UBF2 871 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 KLHL3Q9UH77 587 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PSMD13Q9UNM6 376 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ASF1AQ9Y294 204 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 HYOU1Q9Y4L1 999 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ENO4A6NNW6 628 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 KATNA1O75449 491 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ARNTP27540 789 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PDHA2P29803 388 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PTGER4P35408 488 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 FNTAP49354 379 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TTLL9Q3SXZ7 439 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CDKL4Q5MAI5 379 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ZADH2Q8N4Q0 377 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 OR2L3Q8NG85 312 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SMPDL3AQ92484 453 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 FOPNLQ96NB1 174 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TRIM55Q9BYV6 548 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 GOLPH3Q9H4A6 298 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC22A11Q9NSA0 550 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CUTCQ9NTM9 273 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 TXLNGQ9NUQ3 528 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 BFARQ9NZS9 450 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ABI3Q9P2A4 366 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PLAAQ9Y263 795 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 SLC5A6Q9Y289 635 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 BLACEA4D250 179 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 GPR39O43194 453 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 STSP08842 583 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 CMPK1P30085 196 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 GRIA3P42263 894 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 ATP1A4Q13733 1029 aa5.5□□□□□ -1.53
ANKRD49-208ENST00000544253 PTK6Q13882 451 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms