RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540719.1

QKI-211, Transcript of QKI, KH domain containing RNA binding, humanhuman

TSL 2

Gene QKI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QKI-211ENST00000540719 APRTP07741 180 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 NMBRP28336 390 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 OTX2P32243 289 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MAGEA6P43360 314 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TTPAP49638 278 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 YBX1P67809 324 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CRADDP78560 199 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 RAPSNQ13702 412 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SLC9A5Q14940 896 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 NKG7Q16617 165 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SYTL3Q4VX76 610 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MPP5Q8N3R9 675 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 DTWD1Q8N5C7 304 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 OR6P1Q8NGX9 317 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 LPGAT1Q92604 370 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ALS2CR12Q96Q35 445 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TTC1Q99614 292 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MFRPQ9BY79 579 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 IL22Q9GZX6 179 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 LUZP4Q9P127 313 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 NTNG1Q9Y2I2 539 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa8.43□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 OR2A25A4D2G3 310 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 KDM1AO60341 852 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 LDLRP01130 860 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 IGHEP01854 428 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 RPN2P04844 631 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 APOA4P06727 396 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TPSB2P20231 275 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MCM3P25205 808 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ATP5DP30049 168 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 FOLR3P41439 243 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 NPY2RP49146 381 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ARSFP54793 590 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 PRAMEP78395 509 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 Q0VFX4 171 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SNX1Q13596 522 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TPSAB1Q15661 275 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CYP2A13Q16696 494 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 PRTGQ2VWP7 1150 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TCTE1Q5JU00 501 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 FHL5Q5TD97 284 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ARMC3Q5W041 872 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 FBXO42Q6P3S6 717 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 C4orf22Q6V702 233 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 RNF44Q7L0R7 432 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CUZD1Q86UP6 607 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 HOOK3Q86VS8 718 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 LRRC6Q86X45 466 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 DLG3Q92796 817 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MFSD3Q96ES6 412 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 NDC1Q9BTX1 674 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CUTCQ9NTM9 273 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 GALPQ9UBC7 116 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 MED16Q9Y2X0 877 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.42□□□□□ -1.06
QKI-211ENST00000540719 CSAG2Q9Y5P2 127 aa8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms