RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	TSPAN17	Q96FV3	270 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PKP4	Q99569	1192 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MIPEP	Q99797	713 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		13.35	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059		E7EQ34	232 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PIAS1	O75925	651 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FKBP9	O95302	570 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MAG	P20916	626 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ITGA1	P56199	1179 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GPX6	P59796	221 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NAB1	Q13506	487 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	IFT20	Q8IY31	132 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	NKD1	Q969G9	470 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	OLFM1	Q99784	485 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	MENT	Q9BUN1	341 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	GPAM	Q9HCL2	828 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM184B	Q9Y519	407 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		13.34	□□□□□ -0.27
CHID1-222	ENST00000533059	CACNA1B	Q00975	2339 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	SLC16A5	O15375	505 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	SLC16A8	O95907	504 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	NTRK1	P04629	796 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF28	P17035	718 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	PSMB5	P28074	263 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	POU4F1	Q01851	419 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	VAC14	Q08AM6	782 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ABHD18	Q0P651	414 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	MAP7	Q14244	749 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF460	Q14592	562 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	GRTP1	Q5TC63	336 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	CYS1	Q717R9	158 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ADCK2	Q7Z695	626 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	DTX1	Q86Y01	620 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	MED8	Q96G25	268 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	RBBP8	Q99708	897 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	PARVB	Q9HBI1	364 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	TAC3	Q9UHF0	121 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		13.33	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	GFY	I3L273	518 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	OR2B3	O76000	313 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	TIAF1	O95411	115 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	DLGAP3	O95886	979 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ERG	P11308	486 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	STMN1	P16949	149 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	TAS2R39	P59534	338 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	TEX35	Q5T0J7	233 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	RAPH1	Q70E73	1250 aa		13.32	□□□□□ -0.28
CHID1-222	ENST00000533059	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.32	□□□□□ -0.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms