RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 CDH7Q9ULB5 785 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF839A8K0R7 811 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ARNTLO00327 626 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 TPPPO94811 219 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC7A1P30825 629 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 P2RY2P41231 377 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 BNIP2Q12982 314 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 XKR5Q6UX68 686 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 CPA6Q8N4T0 437 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 SELENOMQ8WWX9 145 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 SUSD6Q92537 303 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 OR2AG1Q9H205 316 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 PRSS16Q9NQE7 514 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 CKAP5Q14008 2032 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 DOCK9Q9BZ29 2069 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 NPC1O15118 1278 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ARPC2O15144 300 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 NPPAP01160 153 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 EPHX1P07099 455 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 CD22P20273 847 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 LIPEQ05469 1076 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 SPATS1Q496A3 300 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 BCL7AQ4VC05 210 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 LCN8Q6JVE9 175 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 LRTOMTQ8WZ04 291 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 GATA6Q92908 595 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 KXD1Q9BQD3 176 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 SNX6Q9UNH7 406 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-229ENST00000515802 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 KAT7O95251 611 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 BCKDHAP12694 445 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 UQCRBP14927 111 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 GPR1P46091 355 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 DPTQ07507 201 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CHIT1Q13231 466 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TMEM52BQ4KMG9 183 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CACHD1Q5VU97 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IFNEQ86WN2 208 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PPM1MQ96MI6 270 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 MYADMQ96S97 322 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 DYRK4Q9NR20 520 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 USP22Q9UPT9 525 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ATG2BQ96BY7 2078 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC16A8O95907 504 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CATP04040 527 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 HALP42357 657 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CLCN2P51788 898 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 POLE2P56282 527 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CNTN1Q12860 1018 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SELPLGQ14242 412 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 HID1Q8IV36 788 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 RNF175Q8N4F7 328 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ICA1LQ8NDH6 482 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SLC13A3Q8WWT9 602 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 CLMPQ9H6B4 373 aa14.64□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 AQP12BA6NM10 295 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 E7EQ34 232 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 STAMBPO95630 424 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 JUPP14923 745 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 IMPA1P29218 277 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PLIN5Q00G26 463 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 HYAL1Q12794 435 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.63□□□□□ -0.07
SH3BP2-229ENST00000515802 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms