RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	P2RY6	Q15077	328 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CA9	Q16790	459 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	NUDT13	Q86X67	352 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SETD6	Q8TBK2	473 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SPAG5	Q96R06	1193 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	RAD9A	Q99638	391 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	LITAF	Q99732	161 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	MIS12	Q9H081	205 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.99	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	HHLA1	C9JL84	531 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	PTGES	O14684	152 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF197	O14709	1029 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	EML2	O95834	649 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	GNB3	P16520	340 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CA6	P23280	308 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	JAK1	P23458	1154 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	NPY4R	P50391	375 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	GNB1	P62873	340 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CDR2	Q01850	454 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	MZT1	Q08AG7	82 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF415	Q09FC8	603 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	METTL23	Q86XA0	190 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CDK20	Q8IZL9	346 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	THAP8	Q8NA92	274 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	GIMAP5	Q96F15	307 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ZWILCH	Q9H900	591 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	FGF21	Q9NSA1	209 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM17	Q9Y577	477 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	EDIL3	O43854	480 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSL3	O95573	720 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	IFNAR1	P17181	557 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CYP11B2	P19099	503 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	GP5	P40197	560 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ASCL1	P50553	236 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CAPZA1	P52907	286 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	LIMK1	P53667	647 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77	4e-12	■□□□□ 11.1
PTPRK-215	ENST00000498284	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	GTDC1	Q4AE62	458 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	HECTD3	Q5T447	861 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	PET117	Q6UWS5	81 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	PIGZ	Q86VD9	579 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	EID3	Q8N140	333 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	OTUB1	Q96FW1	271 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	LRR1	Q96L50	414 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	FEV	Q99581	238 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	CPNE1	Q99829	537 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	MGME1	Q9BQP7	344 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		3.97	□□□□□ -1.77
PTPRK-215	ENST00000498284	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		3.97	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms