RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	APOL1	O14791	398 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ALOX12B	O75342	701 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	JRK	O75564	520 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRH	P07919	91 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	STS	P08842	583 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MSL3P1	P0C860	447 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RALB	P11234	206 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NOMO1	Q15155	1222 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ODF2	Q5BJF6	829 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FCRL6	Q6DN72	434 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT14	Q8WUY8	206 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	NDC1	Q9BTX1	674 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	GLOD4	Q9HC38	313 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	HACD3	Q9P035	362 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRD1	A4D1F6	860 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BTN3A3	O00478	584 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF1	O95521	474 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	BPNT1	O95861	308 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR1E	P28566	365 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX8	P57073	446 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK10	P57789	538 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXL2	P58012	376 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC14A2	Q15849	920 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	STX1A	Q16623	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SARM1	Q6SZW1	724 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DAAM2	Q86T65	1068 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM73	Q86UV7	250 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF398	Q8TD17	642 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FAF2	Q96CS3	445 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS50	Q96JG6	964 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF157	Q96PX1	679 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	HGH1	Q9BTY7	390 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	XKR8	Q9H6D3	395 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17C	Q9P0M4	197 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	APC	P25054	2843 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PROSC	O94903	275 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP1A2	P05177	515 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	KDELR1	P24390	212 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	WNT3A	P56704	352 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R40	P59535	323 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	DYNLT1	P63172	113 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKG2	Q13237	762 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX44	Q53QW1	395 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MTFR2	Q6P444	385 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SPESP1	Q6UW49	350 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CPNE8	Q86YQ8	564 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX6	Q8HWS3	928 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	IPMK	Q8NFU5	416 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	HM13	Q8TCT9	377 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	RAPGEF5	Q92565	580 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	LHPP	Q9H008	270 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB8	Q9H765	288 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL21	O00585	134 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PF4	P02776	101 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	UMOD	P07911	640 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	MMP11	P24347	488 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SKAP2-209	ENST00000497511	ARG2	P78540	354 aa		10.41	□□□□□ -0.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms