RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495327.1

RBM28-208, Transcript of RNA binding motif protein 28, human

TSL 2

Gene RBM28, Length 395 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM28-208	ENST00000495327	SPTA1	P02549	2419 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	TENM4	Q6N022	2769 aa		12.84	□□□□□ -0.35
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327		B8ZZF3	427 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	MYO1C	O00159	1063 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TTI1	O43156	1089 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF749	O43361	778 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	HCRTR1	O43613	425 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	BANF1	O75531	89 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	OR2B3	O76000	313 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	FURIN	P09958	794 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CBSL	P0DN79	551 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CBS	P35520	551 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	MPP1	Q00013	466 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	KCNAB2	Q13303	367 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CYP2A13	Q16696	494 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	UGT8	Q16880	541 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	BBS9	Q3SYG4	887 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	GALNT7	Q86SF2	657 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	PDIK1L	Q8N165	341 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CD200R1	Q8TD46	325 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CERS2	Q96G23	380 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SNF8	Q96H20	258 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SLC30A3	Q99726	388 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	NLN	Q9BYT8	704 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CHST8	Q9H2A9	424 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	DHRS7	Q9Y394	339 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		12.83	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327		A0A1W2PPV9	198 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	KRT87P	A6NCN2	255 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TARM1	B6A8C7	271 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	NDC80	O14777	642 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TP73	O15350	636 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	VPS26A	O75436	327 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	HAUS5	O94927	633 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CAPN1	P07384	714 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	MPC1L	P0DKB6	136 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	GCGR	P47871	477 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ERV3-1	Q14264	604 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	NAA25	Q14CX7	972 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	HIF1A	Q16665	826 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	STEAP4	Q687X5	459 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	FCRL6	Q6DN72	434 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	OR2L3	Q8NG85	312 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	INPP5D	Q92835	1189 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	GPR21	Q99679	349 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	EURL	Q9NYK6	297 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		12.82	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CDC14C	A4D256	554 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ERVK-10	P10266	1014 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	PLA2G2A	P14555	144 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	AGXT	P21549	392 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	PSMB5	P28074	263 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	HSD17B2	P37059	387 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ELK3	P41970	407 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	GRIA3	P42263	894 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ITGA8	P53708	1063 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	PMS2	P54278	862 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	ARL4C	P56559	192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	NFATC3	Q12968	1075 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CBLB	Q13191	982 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	CUL1	Q13616	776 aa		12.81	□□□□□ -0.36
RBM28-208	ENST00000495327	IL10RA	Q13651	578 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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