RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494297.5

SRPRB-205, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-205ENST00000494297 THSD1Q9NS62 852 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OCIAD1Q9NX40 245 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SPHK1Q9NYA1 384 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TXNDC16Q9P2K2 825 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF180Q9UJW8 692 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BTRCQ9Y297 605 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 KLK4Q9Y5K2 254 aa5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PTPRBP23467 1997 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 A0A0J9YY10 115 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 A0A1W2PPV9 198 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HMX2A2RU54 273 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PMS2P1A4D2B8 440 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ISM1B1AKI9 464 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TARM1B6A8C7 271 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 C9orf172C9J069 976 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 E7ENX8 843 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RIPK2O43353 540 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RASSF9O75901 435 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FAM155BO75949 473 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ACSL3O95573 720 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC16A8O95907 504 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ABHD2P08910 425 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FAM153BP0C7A2 387 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MYBL2P10244 700 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FGF5P12034 268 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HGFP14210 728 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FOLR1P15328 257 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 UGT2B7P16662 529 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 STMN1P16949 149 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HIST1H2ADP20671 130 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CYP2A7P20853 494 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CDH3P22223 829 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CNTFP26441 200 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CD82P27701 267 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CRABP2P29373 138 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OAS2P29728 719 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC5A2P31639 672 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 BDKRB1P46663 353 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PGGT1BP53609 377 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PNLIPRP1P54315 467 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC12A2P55011 1212 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RAB10P61026 200 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HSD11B2P80365 405 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CDKL1Q00532 357 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ACY1Q03154 408 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TAP2Q03519 686 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 RELAQ04206 551 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SLC29A2Q14542 456 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 FAM153CQ494X1 144 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TEX35Q5T0J7 233 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DCAF12Q5T6F0 453 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 WDR93Q6P2C0 686 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CYB5D1Q6P9G0 228 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 SPESP1Q6UW49 350 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CCDC91Q7Z6B0 441 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PROSER1Q86XN7 944 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DTX1Q86Y01 620 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PARP9Q8IXQ6 854 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 DNAJC22Q8N4W6 341 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OR2A1Q8NGT9 310 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 OR8K5Q8NH50 307 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ZNF480Q8WV37 535 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ANKRD49Q8WVL7 239 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 USP7Q93009 1102 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ISL2Q96A47 359 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 ITPKCQ96DU7 683 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 LINGO1Q96FE5 620 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 TCTN2Q96GX1 697 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 PPM1MQ96MI6 270 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 IL17FQ96PD4 163 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 HIST1H2AJQ99878 128 aa5.19□□□□□ -1.58
SRPRB-205ENST00000494297 H2AFJQ9BTM1 129 aa5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms