RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MLIPQ5VWP3 458 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MRNIPQ6NTE8 343 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FIGLAQ6QHK4 219 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MED25Q71SY5 747 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa26.7■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ONECUT2O95948 504 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 KRT14P02533 472 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ESR1P03372 595 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 UMODP07911 640 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 OGNP20774 298 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 GRIA3P42263 894 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SSPNQ14714 243 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SLC9A5Q14940 896 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 RAB43Q86YS6 212 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CILP2Q8IUL8 1156 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SPNS2Q8IVW8 549 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 OR2A1Q8NGT9 310 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 OR2Y1Q8NGV0 311 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 C17orf62Q9BQA9 187 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SLC39A10Q9ULF5 831 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CRYL1Q9Y2S2 319 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF185O15231 689 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 NRP2O60462 931 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CTSVO60911 334 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ERGP11308 486 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MCM3P25205 808 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ATP5DP30049 168 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 OTX2P32243 289 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEA3P43357 314 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 YBX1P67809 324 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CNSTQ6PJW8 725 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FAM136AQ96C01 138 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 NDC1Q9BTX1 674 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MED16Q9Y2X0 877 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 JRKLQ9Y4A0 524 aa26.68■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FKBP9O95302 570 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 F7P08709 466 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MLNP12872 115 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 COILP38432 576 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CYP2A13Q16696 494 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 COX15Q7KZN9 410 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MCUQ8NE86 351 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 PBKQ96KB5 322 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 TXLNGQ9NUQ3 528 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MAST4O15021 2626 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 TARM1B6A8C7 271 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ACSBG2Q5FVE4 666 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 NEPROQ6NW34 567 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 REXO1L1PQ8IX06 675 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 Q8NA96 180 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 OR2L3Q8NG85 312 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZUFSPQ96AP4 578 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SERPINB12Q96P63 405 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SLC30A3Q99726 388 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FITM1A5D6W6 292 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 A6NL46 340 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 H3BMM5 538 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MED26O95402 600 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CCNFP41002 786 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 FOLR3P41439 243 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 CLCN7P51798 805 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 RRADP55042 308 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 TTLL10Q6ZVT0 673 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 DTWD1Q8N5C7 304 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 GIMAP7Q8NHV1 300 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 GSDMBQ8TAX9 411 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 COG1Q8WTW3 980 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 MIPEPQ99797 713 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 SPATA7Q9P0W8 599 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 NDOR1Q9UHB4 597 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXB3-211ENST00000490677 ESPL1Q14674 2120 aa26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms