RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 RPA4Q13156 261 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CAMK1Q14012 370 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ADRM1Q16186 407 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 FXNQ16595 210 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PAGE2BQ5JRK9 111 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 LPCAT4Q643R3 524 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 FRG2Q64ET8 278 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM154Q6P9G4 183 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 YAF2Q8IY57 180 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 RNF148Q8N7C7 305 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TRPV3Q8NET8 790 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ITFG1Q8TB96 612 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ING5Q8WYH8 240 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 SUSD6Q92537 303 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 UBE2E3Q969T4 207 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ESAMQ96AP7 390 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TESCQ96BS2 214 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 NUS1Q96E22 293 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ITCHQ96J02 903 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 COQ10AQ96MF6 247 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC115Q96NT0 180 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 FRG2BQ96QU4 278 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 C9orf16Q9BUW7 83 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 HDAC8Q9BY41 377 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 BRF2Q9HAW0 419 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ZFP14Q9HCL3 533 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 GPR34Q9UPC5 381 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ASB1Q9Y576 335 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 HTTP42858 3142 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 A0A1B0GTL3 188 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF839A8K0R7 811 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 H0YIV9 168 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 AREL1O15033 823 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ANKRD28O15084 1053 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ARPC2O15144 300 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TSPAN6O43657 245 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TNFAIP8O95379 198 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PGRP06401 933 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CA3P07451 260 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CTSLP07711 333 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 LYNP07948 512 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 BMP4P12644 408 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ADRB3P13945 408 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 IL1RNP18510 177 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PRPS1L1P21108 318 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 TEAD1P28347 426 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 S100A3P33764 101 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CA5AP35218 305 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ETV3P41162 512 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 GRIA3P42263 894 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 HALP42357 657 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CASP2P42575 452 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 GDF5P43026 501 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 GPR1P46091 355 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ASMTP46597 345 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 GSK3BP49841 420 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 HTR6P50406 440 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 ERFP50548 548 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 CHN2P52757 468 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 AQP4P55087 323 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 NME5P56597 212 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 C21orf58P58505 322 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-243ENST00000488923 PHEXP78562 749 aa6.44□□□□□ -1.38
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