RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	RALB	P11234	206 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CDH3	P22223	829 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GJC1	P36383	396 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CD86	P42081	329 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GLRB	P48167	497 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ITGA1	P56199	1179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CDK18	Q07002	472 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FAP	Q12884	760 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IL10RA	Q13651	578 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	GALNT3	Q14435	633 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PDK2	Q15119	407 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NUP85	Q9BW27	656 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	CHST8	Q9H2A9	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LUZP4	Q9P127	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	NDOR1	Q9UHB4	597 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ACSL5	Q9ULC5	683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	PKP3	Q9Y446	797 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UBP1-210	ENST00000486388	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.59	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CENPE	Q02224	2701 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR6C74	A6NCV1	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		E7EQ34	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AQP7	O14520	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LDB2	O43679	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KRT86	O43790	486 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MFSD11	O43934	449 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	KDM1A	O60341	852 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MTX2	O75431	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CEACAM4	O75871	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CBX6	O95503	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	CLDN1	O95832	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	LDLR	P01130	860 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PRL	P01236	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MSL3P1	P0C860	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	BRAF	P15056	766 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ITGAX	P20702	1163 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IL4R	P24394	825 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	IL1R2	P27930	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	OTX2	P32243	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	HADHA	P40939	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	FOLR3	P41439	243 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	AP1B1	Q10567	949 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPS2	Q13227	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RAPSN	Q13702	412 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	ITGA9	Q13797	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	PDK1	Q15118	436 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	GPR19	Q15760	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UBP1-210	ENST00000486388	RPE65	Q16518	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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