RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 POU6F1Q14863 301 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 BRD3Q15059 726 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TLR1Q15399 786 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 CYP2A13Q16696 494 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FCRL6Q6DN72 434 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MTFR2Q6P444 385 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 NAPRTQ6XQN6 538 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 NR4A3Q92570 626 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PTERQ96BW5 349 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 SPOCK3Q9BQ16 436 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 OSBPL8Q9BZF1 889 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 DLL4Q9NR61 685 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TXLNGQ9NUQ3 528 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ASF1AQ9Y294 204 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 EFR3BQ9Y2G0 817 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS21Q9Y6M0 314 aa9.05□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FANCGO15287 622 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 CLDN14O95500 239 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 CD63P08962 238 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 NSG1P42857 185 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 GCGRP47871 477 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR2DS3Q14952 304 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 KCTD11Q693B1 232 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FAAH2Q6GMR7 532 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TLDC1Q6P9B6 456 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00696Q6ZRV3 163 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TBC1D21Q8IYX1 336 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5K2Q8NHB8 316 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 COG1Q8WTW3 980 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ELMO1Q92556 727 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ALG3Q92685 438 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 SMR3AQ99954 134 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 NDC1Q9BTX1 674 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 POLG2Q9UHN1 485 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TINAGQ9UJW2 476 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 STAB1Q9NY15 2570 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC162PA2VCL2 907 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MROH6A6NGR9 719 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 OR51F1A6NGY5 319 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ISM1B1AKI9 464 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 AGPSO00116 658 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL18O95568 372 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 AP2A1O95782 977 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FTH1P02794 183 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGP20916 626 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ALAS2P22557 587 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MMP11P24347 488 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMA3P25788 255 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MSNP26038 577 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MST1P26927 711 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PKLRP30613 574 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ITIH4Q14624 930 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 C3AR1Q16581 482 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 SYTL3Q4VX76 610 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 AADACL2Q6P093 401 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 PACS1Q6VY07 963 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM200AQ86VY9 491 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM71DQ8N9W8 422 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 ACBD4Q8NC06 268 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 STYXQ8WUJ0 223 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 FKBP10Q96AY3 582 aa9.03□□□□□ -0.96
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC45Q96CN5 670 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms