RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC30A8Q8IWU4 369 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACBD6Q9BR61 282 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUP50Q9UKX7 468 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC42Q9Y546 428 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AOC2O75106 756 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DSC3Q14574 896 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2L3Q8NG85 312 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM203Q969S6 136 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM129BQ96TA1 746 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CGREF1Q99674 301 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LGR4Q9BXB1 951 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2AT4A6NND4 320 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAP18O00422 153 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSMD8P48556 350 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNASE1L3Q13609 305 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PMM1Q92871 262 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXL20Q96IG2 436 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FZD4Q9ULV1 537 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAU2Q9Y6X3 613 aa16.8■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1B0GVM2 712 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PQ67 120 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAPN15O75808 1086 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SELPP16109 830 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ENGP17813 658 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC2A7Q6PXP3 512 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCRL5Q96RD9 977 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MARK1Q9P0L2 795 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MED31Q9Y3C7 131 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DCLK1O15075 740 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ECI2O75521 394 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALPPP05187 535 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC15A1P46059 708 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AP1S1P61966 158 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLL1O43897 1013 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACVR2AP27037 513 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MVKQ03426 396 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL14Q16627 93 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP76Q8TAP6 659 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LMLNQ96KR4 655 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF69Q9UC07 566 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL7RP16871 459 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ECHS1P30084 290 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CRB2Q5IJ48 1285 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MARCH9Q86YJ5 346 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDH7O60245 1069 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSG1P42857 185 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMGCS1Q01581 520 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C4orf46Q504U0 113 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OXR1Q8N573 874 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF639Q9UID6 485 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POFUT2Q9Y2G5 429 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.79■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYBPHLA2RUH7 354 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRAMEF12O95522 483 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSK3BP49841 420 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LILRA4P59901 499 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2T5Q6IEZ7 315 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 XKR5Q6UX68 686 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOMM5Q8N4H5 51 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2T29Q8NH02 315 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PADI3Q9ULW8 664 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COQ4Q9Y3A0 265 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DLX3O60479 287 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXCL14O95715 111 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINGO3P0C6S8 592 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CPN2P22792 545 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KELP23276 732 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AVPR1BP47901 424 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXM1Q08050 763 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TLR1Q15399 786 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SH3D19Q5HYK7 790 aa16.78■□□□□ 0.28
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms