RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 XKR6Q5GH73 641 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 RAET1GQ6H3X3 334 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GLYATQ6IB77 296 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TERB1Q8NA31 727 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 NSMCE2Q96MF7 247 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GBP5Q96PP8 586 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 FAM129BQ96TA1 746 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SLC29A1Q99808 456 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM245Q9H330 911 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 HPS4Q9NQG7 708 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GDE1Q9NZC3 331 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 LRRK1Q38SD2 2015 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PLK4O00444 970 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CKMT2P17540 419 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GPR1P46091 355 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF33BQ06732 778 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 NAE1Q13564 534 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 RNF220Q5VTB9 566 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PPP4R4Q6NUP7 873 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SFTPA1Q8IWL2 248 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 FOXJ1Q92949 421 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 MED8Q96G25 268 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa16.68■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 H3BM21 787 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 K7ESM1 405 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 MMP20O60882 483 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 ACPPP15309 386 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CCSMST1Q4G0I0 132 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM74Q86UV6 250 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 AADATQ8N5Z0 425 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PACRGLQ8N7B6 248 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PHC3Q8NDX5 983 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJB8Q8NHS0 232 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SUSD6Q92537 303 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 BIRC7Q96CA5 298 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 APIPQ96GX9 242 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PKP4Q99569 1192 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SH3GL1Q99961 368 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 OR2AG1Q9H205 316 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 FAM149AA5PLN7 773 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TBC1D3BA6NDS4 549 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GMNNO75496 209 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 AMD1P17707 334 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PSMC3P17980 439 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SDC1P18827 310 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 PDHA2P29803 388 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 S100A3P33764 101 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CYP4F3Q08477 520 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DSG4Q86SJ6 1040 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DTWD1Q8N5C7 304 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TSSK3Q96PN8 268 aa16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 E7EQ34 232 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SOCS2O14508 198 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 SLC16A8O95907 504 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CD22P20273 847 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 FCARP24071 287 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 IMPA1P29218 277 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CLCN2P51788 898 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DPTQ07507 201 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GTF2H3Q13889 308 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM52BQ4KMG9 183 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CPA6Q8N4T0 437 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TNIP2Q8NFZ5 429 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 OR2T12Q8NG77 320 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 APOLD1Q96LR9 279 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF583Q96ND8 569 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC115Q96NT0 180 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DZANK1Q9NVP4 752 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 AP3M1Q9Y2T2 418 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 LILRB5O75023 590 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 GGT1P19440 569 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TACR1P25103 407 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 HNF4AP41235 474 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 CCT8P50990 548 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 DOC2AQ14183 400 aa16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
FAAP20-211ENST00000469733 TANGO2Q6ICL3 276 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms