RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466681.1

MALSU1-202, Transcript of mitochondrial assembly of ribosomal large subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MALSU1, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1-202ENST00000466681 A0A0C4DFX4 3053 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 IQCF5A8MTL0 148 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 C22orf31O95567 290 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MYL9P24844 172 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 DAOAP59103 153 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 EFR3AQ14156 821 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 NFE2L1Q14494 772 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 IHHQ14623 411 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 GNASQ5JWF2 1037 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FAM171A1Q5VUB5 890 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 OR2T5Q6IEZ7 315 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CRYBG2Q8N1P7 616 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 OR2T29Q8NH02 315 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ZNF566Q969W8 418 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PYURFQ96I23 114 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.67□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MYLKQ15746 1914 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 COL1A2P08123 1366 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CIB4A0PJX0 185 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 I3L521 148 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MATN3O15232 486 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SLITRK5O94991 958 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SERPINF2P08697 491 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 DNAJB2P25686 324 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 GDF5P43026 501 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 VLDLRP98155 873 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FADDQ13158 208 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 DUSP7Q16829 419 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 TSPEARQ8WU66 669 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 APH1BQ8WW43 257 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 TMCO6Q96DC7 493 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 GPR39O43194 453 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 NIPSNAP2O75323 286 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 RGS6P49758 472 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MAPK12P53778 367 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CASP9P55211 416 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 NFKB2Q00653 900 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ST3GAL4Q11206 333 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 NPRL3Q12980 569 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 IL18R1Q13478 541 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 OR56A4Q8NGH8 313 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 RNF170Q96K19 258 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 INPP5KQ9BT40 448 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PCTPQ9UKL6 214 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 HMX3A6NHT5 357 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SNTNA6NMZ2 147 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 HBP1O60381 514 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 OR2B3O76000 313 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SNX4O95219 450 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PGRP06401 933 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FDXRP22570 491 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CCNCP24863 283 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ELP6Q0PNE2 266 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SPATS1Q496A3 300 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 XKR7Q5GH72 579 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SIRPB2Q5JXA9 342 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FAM83AQ86UY5 434 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 LIX1Q8N485 282 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ANKHQ9HCJ1 492 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SLC6A14Q9UN76 642 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.66□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 B8ZZF3 427 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 GFRA2O00451 464 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 KERAO60938 352 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SEC22BO75396 215 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PRR35P0CG20 571 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 SLC9A3P48764 834 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 PTPRNQ16849 979 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 TOR2AQ5JU69 321 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 DPP10Q8N608 796 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 FLCNQ8NFG4 579 aa14.65□□□□□ -0.06
MALSU1-202ENST00000466681 MSANTD3Q96H12 275 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms