RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 CPA6Q8N4T0 437 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 AADATQ8N5Z0 425 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY4Q8NFM4 1077 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 OR52E4Q8NGH9 312 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FAM110BQ8TC76 370 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 UCMAQ8WVF2 138 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ELMO1Q92556 727 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GTF2H4Q92759 462 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FOXJ1Q92949 421 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RAB7BQ96AH8 199 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TESCQ96BS2 214 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NUS1Q96E22 293 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DCUN1D1Q96GG9 259 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC115Q96NT0 180 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 PKP4Q99569 1192 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MENTQ9BUN1 341 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NANOGQ9H9S0 305 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CERS4Q9HA82 394 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LRTM1Q9HBL6 345 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM39Q9HCM9 518 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BATF3Q9NR55 127 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC11Q9NVH1 559 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf109Q9NX04 203 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF639Q9UID6 485 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PPT2Q9UMR5 302 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GPR34Q9UPC5 381 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 K7EQS6 105 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FFAR3O14843 346 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ANGPT2O15123 496 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 GPR42O15529 346 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RGS14O43566 566 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 MMP20O60882 483 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ULK1O75385 1050 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CRCPO75575 148 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PRSS23O95084 383 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf105O95561 183 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 KRT6BP04259 564 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 BMP2P12643 396 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LAMP2P13473 410 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 SDC1P18827 310 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2A7P20853 494 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TACR1P25103 407 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HSD3B2P26439 372 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM23P36406 574 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 LTBRP36941 435 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GRIA2P42262 883 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 GNPDA1P46926 289 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PREPP48147 710 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 KRT6CP48668 564 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CCR3P51677 355 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CLCN2P51788 898 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DGKQP52824 942 aa5.48□□□□□ -1.53
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PTPRC-210ENST00000462363 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 HTR4Q13639 388 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 NFYCQ13952 458 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 DOC2AQ14183 400 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 FGL2Q14314 439 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 PTGR1Q14914 329 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ACOX1Q15067 660 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 RAB30Q15771 203 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRC-210ENST00000462363 MUM1Q2TAK8 710 aa5.48□□□□□ -1.53
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