RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	MICU2	Q8IYU8	434 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	NATD1	Q8N6N6	113 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	NAT14	Q8WUY8	206 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM162A	Q96A26	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	AP2M1	Q96CW1	435 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	AURKB	Q96GD4	344 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	REXO5	Q96IC2	774 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	RNF145	Q96MT1	663 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR34	Q9UPC5	381 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	ASB1	Q9Y576	335 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		11.21	□□□□□ -0.61
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758		A8MX80	341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR39	O43194	453 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SGTA	O43765	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MOSPD3	O75425	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PRSS23	O95084	383 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CCNDBP1	O95273	360 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PAPLN	O95428	1278 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TIMP2	P16035	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SYN1	P17600	705 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	GSTT1	P30711	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINB1	P30740	379 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CCR2	P41597	374 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NRIP1	P48552	1158 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ERVFC1	P60507	584 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MYBPC1	Q00872	1141 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DPT	Q07507	201 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RPA4	Q13156	261 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CHIT1	Q13231	466 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	IL18R1	Q13478	541 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ACOX1	Q15067	660 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PTPRR	Q15256	657 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PGBD3	Q8N328	593 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CHST14	Q8NCH0	376 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS50	Q96JG6	964 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TEX37	Q96LM6	180 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	PPM1M	Q96MI6	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RBM4	Q9BWF3	364 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CHID1	Q9BWS9	393 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ACPT	Q9BZG2	426 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ACTL8	Q9H568	366 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DEC1	Q9P2X7	70 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	CCL26	Q9Y258	94 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	ALPK3	Q96L96	1907 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TTLL3-222	ENST00000459758	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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