RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458294.5

PBRM1-218, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 476 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-218ENST00000458294 FAR1Q8WVX9 515 aa25.27■■□□□ 1.64
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF285Q96NJ3 590 aa25.27■■□□□ 1.64
PBRM1-218ENST00000458294 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.27■■□□□ 1.64
PBRM1-218ENST00000458294 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PBRM1-218ENST00000458294 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.27■■□□□ 1.64
PBRM1-218ENST00000458294 LRBAP50851 2863 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 HEATR9A2RTY3 570 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 LRRTM2O43300 516 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 GPC4O75487 556 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FKBP9O95302 570 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 GAS8O95995 478 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 GOT2P00505 430 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 GRB7Q14451 532 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TLR1Q15399 786 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 RBBP7Q16576 425 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FCRL6Q6DN72 434 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FIGLAQ6QHK4 219 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 VRK3Q8IV63 474 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 DNAAF3Q8N9W5 541 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 HDAC10Q969S8 669 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TMEM121Q9BTD3 319 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CARD6Q9BX69 1037 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 OSGIN2Q9Y236 505 aa25.26■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CROCCQ5TZA2 2017 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FITM1A5D6W6 292 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 RASGRF2O14827 1237 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TNFRSF8P28908 595 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SF1Q15637 639 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FAM214AQ32MH5 1076 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 PARP9Q8IXQ6 854 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CNDP1Q96KN2 507 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 IL17FQ96PD4 163 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CTSFQ9UBX1 484 aa25.25■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 VSTM2BA6NLU5 285 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TARM1B6A8C7 271 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 APOA4P06727 396 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 MCM3P25205 808 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 GRIA3P42263 894 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ACVR1Q04771 509 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TSTD2Q5T7W7 516 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TAX1BP1Q86VP1 789 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 OR4L1Q8NH43 312 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CFAP61Q8NHU2 1237 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ZUFSPQ96AP4 578 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SLC39A10Q9ULF5 831 aa25.24■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ISLR2Q6UXK2 745 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ZNF534Q76KX8 674 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 UBL4BQ8N7F7 174 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TRIM5Q9C035 493 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CIDEBQ9UHD4 219 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 AMFRQ9UKV5 643 aa25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SLCO2B1O94956 709 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ADRA1DP25100 572 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 OR1D4P47884 311 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CARSP49589 748 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 MFAP5Q13361 173 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TMED2Q15363 201 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 TTC23LQ6PF05 361 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FAM180AQ6UWF9 173 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 OR6P1Q8NGX9 317 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 PEX13Q92968 403 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 LMF1Q96S06 567 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SLX1AQ9BQ83 275 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 CRB3Q9BUF7 120 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 ENTPD4Q9Y227 616 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.22■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 SUN1O94901 812 aa25.21■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 HPP00738 406 aa25.21■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 AOAHP28039 575 aa25.21■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 PRAMEP78395 509 aa25.21■■□□□ 1.63
PBRM1-218ENST00000458294 Q0VFX4 171 aa25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms