RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 TARM1B6A8C7 271 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PIAS1O75925 651 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 DLGAP3O95886 979 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP2A7P20853 494 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PHBP35232 272 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP1A2P50993 1020 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PNLIPRP1P54315 467 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TGIF1Q15583 401 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM73Q86UV7 250 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NLGN4XQ8N0W4 816 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PPM1NQ8N819 430 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2A1Q8NGT9 310 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 DLG3Q92796 817 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC138Q96M89 665 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR22Q99680 433 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 RBBP8Q99708 897 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NINJ2Q9NZG7 142 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PDE10AQ9Y233 779 aa16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 EPG5Q9HCE0 2579 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 E7ENX8 843 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 RAD1O60671 282 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC16A8O95907 504 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 MT-ND3P03897 115 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC12A2P55011 1212 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TAP2Q03519 686 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SLMAPQ14BN4 828 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NAA25Q14CX7 972 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR19Q15760 415 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ZIC1Q15915 447 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM207Q6UWW9 146 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC22Q8N4W6 341 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ESX1Q8N693 406 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF480Q8WV37 535 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ULBP3Q9BZM4 244 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM60AQ9NP50 221 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.24■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 USP24Q9UPU5 2620 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT87PA6NCN2 255 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF28P17035 718 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2ADP20671 130 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SAT1P21673 171 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 GABRA4P48169 554 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD18Q0P651 414 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 MANEAQ5SRI9 462 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FIGLAQ6QHK4 219 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CEP97Q8IW35 865 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 OR2L3Q8NG85 312 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CYTH2Q99418 400 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST1H2AJQ99878 128 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 H2AFJQ9BTM1 129 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PLCL2Q9UPR0 1127 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.23■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA0754O94854 1291 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 RHOXF2BP0C7M4 288 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 MAGP20916 626 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 IMPA1P29218 277 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 CMPK1P30085 196 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 GRIA3P42263 894 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PGGT1BP53609 377 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 AP1S2P56377 157 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 TMPRSS3P57727 454 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM20CQ8IXL6 584 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 SYTL1Q8IYJ3 562 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 IL22RA1Q8N6P7 574 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 OR1L3Q8NH93 324 aa16.22■□□□□ 0.19
RABGEF1-204ENST00000442563 LRFN5Q96NI6 719 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms