RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYT14P1Q58G82 188 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ELFN2Q5R3F8 820 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GRTP1Q5TC63 336 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADCK1Q86TW2 530 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNTN4Q8IWV2 1026 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GBGT1Q8N5D6 347 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNH5Q8NCM2 988 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR5M8Q8NGP6 311 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OR52I2Q8NH67 350 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC38A5Q8WUX1 472 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PROX1Q92786 737 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEMA4DQ92854 862 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ABHD8Q96I13 439 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATG101Q9BSB4 218 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPRY4Q9C004 299 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NAPBQ9H115 298 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FKRPQ9H9S5 495 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SERINC1Q9NRX5 453 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPHK1Q9NYA1 384 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C1RLQ9NZP8 487 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RNF150Q9ULK6 438 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDC80O14777 642 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TTI1O43156 1089 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TXNL1O43396 289 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 STAM2O75886 525 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AKAP3O75969 853 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLUD1P00367 558 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM106CPP0CH98 169 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC192P0DO97 292 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MPZP25189 248 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CD27P26842 260 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCNJ1P48048 391 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLUD2P49448 558 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PDX1P52945 283 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KLC1Q07866 573 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MAPK11Q15759 364 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGCBQ16585 318 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTGISQ16647 500 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IFI44LQ53G44 452 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PACS1Q6VY07 963 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCDC83Q8IWF9 413 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IQCF1Q8N6M8 205 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ST7LQ8TDW4 575 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZFAND2BQ8WV99 257 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEPT1Q8WYJ6 367 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGF29Q96ES7 293 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDCA5Q96FF9 252 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PGM2Q96G03 612 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGK494Q96LW2 274 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C3orf30Q96M34 536 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIX4Q9UIU6 781 aa4.69□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM150CB9EJG8 249 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNHIT1O43257 154 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GLCEO94923 617 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WDPCPO95876 746 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HOXC6P09630 235 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTGER4P35408 488 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INAQ16352 499 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 XKR9Q5GH70 373 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMPRSS11BQ86T26 416 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ANKRD46Q86W74 232 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PTOV1Q86YD1 416 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HSCBQ8IWL3 235 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CFAP206Q8IYR0 622 aa4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 AMER3Q8N944 861 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms