RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432292.7

PMS1-212, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PMS1, Length 3,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-212ENST00000432292 LAPTM4AQ15012 233 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 LEMD2Q8NC56 503 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 PLD4Q96BZ4 506 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ZNF599Q96NL3 588 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 BTBD2Q9BX70 525 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 C8orf4Q9NR00 106 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.95■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 A0A1B0GTL3 188 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 C2orf81A6NN90 581 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 MEN1O00255 615 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CDC7O00311 574 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 STX7O15400 261 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CD1DP15813 335 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CR2P20023 1033 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 GNG2P59768 71 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SH3BP2P78314 561 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 METTL4Q8N3J2 472 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ITFG1Q8TB96 612 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 INSL5Q9Y5Q6 135 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CCDC154A6NI56 674 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SCO2O43819 266 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ALX3O95076 343 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 FDXRP22570 491 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 EPHB3P54753 998 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 TSNQ15631 228 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 NPTX1Q15818 432 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 C5orf22Q49AR2 442 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 STON2Q8WXE9 905 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 MYO9BQ13459 2157 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CENPXA8MT69 81 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 PGLSO95336 258 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 TRIM16O95361 564 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 KCNK10P57789 538 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 UNC50Q53HI1 259 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 FAM20CQ8IXL6 584 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SVOPQ8N4V2 548 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 NATD1Q8N6N6 113 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 BEX2Q9BXY8 128 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 TNKS2Q9H2K2 1166 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ZNF639Q9UID6 485 aa15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ANGPTL1O95841 491 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 DNTTP04053 509 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 OR2B6P58173 313 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 GALK2Q01415 458 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CHRNB3Q05901 458 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 PRRG3Q9BZD7 231 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 DCSTAMPQ9H295 470 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SNX6Q9UNH7 406 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ANKRD36A6QL64 1941 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CST1P01037 141 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 F11P03951 625 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 LPOP22079 712 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 DNAJB13P59910 316 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ACVR1Q04771 509 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SULT1C3Q6IMI6 304 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ABCG8Q9H221 673 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 SPG21Q9NZD8 308 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 MED16Q9Y2X0 877 aa15.93■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 MITFO75030 526 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 EFEMP2O95967 443 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 KRT6CP48668 564 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 P2RX3P56373 397 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 UFM1P61960 85 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 TRAF3Q13114 568 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 ENPP6Q6UWR7 440 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 GAREM2Q75VX8 874 aa15.92■□□□□ 0.14
PMS1-212ENST00000432292 GOLM1Q8NBJ4 401 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms