RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

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Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 PKP3Q9Y446 797 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CREBBPQ92793 2442 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SEC16AO15027 2179 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC66A2RUB6 948 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LDB2O43679 373 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ALOX12BO75342 701 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 UMODP07911 640 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRF1P14222 555 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFS1P28331 727 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ADRA1AP35348 466 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP25P42331 645 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 NR2C2P49116 596 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRLHRP49683 370 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TMPRSS15P98073 1019 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRKG2Q13237 762 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MPP3Q13368 585 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 KYNUQ16719 465 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 C1orf189Q5VU69 101 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MLIPQ5VWP3 458 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RANBP10Q6VN20 620 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HPS6Q86YV9 775 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 HM13Q8TCT9 377 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LCN9Q8WX39 176 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SGSM3Q96HU1 749 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GBP5Q96PP8 586 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 FERD3LQ96RJ6 166 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJC7Q99615 494 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SRMSQ9H3Y6 488 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DEF6Q9H4E7 631 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 COG4Q9H9E3 785 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 C5AR2Q9P296 337 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ICKQ9UPZ9 632 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CDYLQ9Y232 598 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ENO4A6NNW6 628 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 E7EQ34 232 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 E2F3O00716 465 aa6.31□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 MYBPC3Q14896 1274 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SLC9A5Q14940 896 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MLANAQ16655 118 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF10Q5QP82 559 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SARM1Q6SZW1 724 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZS92 163 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RAB43Q86YS6 212 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 NXPE1Q8N323 547 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 GALNT16Q8N428 558 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 IQCDQ96DY2 449 aa6.31□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 OR2A14Q96R47 310 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 CCM2Q9BSQ5 444 aa6.31□□□□□ -1.4
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HOXD8-202ENST00000429017 GBA3Q9H227 469 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 FANCEQ9HB96 536 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SPHK1Q9NYA1 384 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 RSPH14Q9UHP6 348 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS21Q9Y6M0 314 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXD8-202ENST00000429017 C2orf74A8MZ97 194 aa6.3□□□□□ -1.4
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