RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 WNT5BQ9H1J7 359 aa4.6□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.6□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.6□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 C15orf61A6NNL5 157 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 ENO4A6NNW6 628 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 GLRA3O75311 464 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 CDK2AP2O75956 126 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 CYP2A7P20853 494 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 SAT1P21673 171 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 CDH3P22223 829 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 OPRL1P41146 370 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRPS1-204ENST00000422939 STAT2P52630 851 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 TAF10Q12962 218 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 CHAF1BQ13112 559 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRPS1-204ENST00000422939 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRPS1-204ENST00000422939 AMER3Q8N944 861 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 PRSS33Q8NF86 280 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 SSMEM1Q8WWF3 244 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 C10orf90Q96M02 699 aa4.59□□□□□ -1.67
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TRPS1-204ENST00000422939 KLK13Q9UKR3 277 aa4.59□□□□□ -1.67
TRPS1-204ENST00000422939 C2orf81A6NN90 581 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MAGEC1O60732 1142 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 VTNP04004 478 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 DANCRP0C864 163 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ALOX12P18054 663 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MMP12P39900 470 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
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TRPS1-204ENST00000422939 HERC3Q15034 1050 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SYT14P1Q58G82 188 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 OR13C3Q8NGS6 347 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF519Q8TB69 540 aa4.58□□□□□ -1.68
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TRPS1-204ENST00000422939 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PANK4Q9NVE7 773 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 VPS28Q9UK41 221 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MOB4Q9Y3A3 225 aa4.58□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CCER2I3L3R5 266 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MEIS2O14770 477 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 EPHB6O15197 1021 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 PI15O43692 258 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 TOMM70O94826 608 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SMIM18P0DKX4 95 aa4.57□□□□□ -1.68
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TRPS1-204ENST00000422939 OR8H2Q8N162 312 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 MINDY1Q8N5J2 469 aa4.57□□□□□ -1.68
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TRPS1-204ENST00000422939 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SLC22A18Q96BI1 424 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 CALML4Q96GE6 196 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 OPA3Q9H6K4 179 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 Q9N2K0 584 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 STK26Q9P289 416 aa4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
TRPS1-204ENST00000422939 STUB1Q9UNE7 303 aa4.57□□□□□ -1.68
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