RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARVELD3Q96A59 401 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A18Q96BI1 424 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS50Q96JG6 964 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLX1AQ9BQ83 275 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA3GQ9NS98 782 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENTPD4Q9Y227 616 aa12.62□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZGRF1Q86YA3 2104 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP10A1A4S6 786 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZG16O60844 167 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPN2P04844 631 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD9P21926 228 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GDF10P55107 478 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRB7Q14451 532 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC38Q502W7 563 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCTE1Q5JU00 501 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AFTPHQ6ULP2 937 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM180AQ6UWF9 173 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VRK3Q8IV63 474 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR11G2Q8NGC1 345 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13J1Q8NGT2 312 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALG3Q92685 438 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF285Q96NJ3 590 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL17FQ96PD4 163 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SELENOSQ9BQE4 189 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENAMQ9NRM1 1142 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CIDEBQ9UHD4 219 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SVILO95425 2214 aa12.61□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FITM1A5D6W6 292 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMD3O43242 534 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCR7P32248 378 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIA3P42263 894 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1D4P47884 311 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSPA14Q0VDF9 509 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q0VFX4 171 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFAP5Q13361 173 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIGLAQ6QHK4 219 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ISLR2Q6UXK2 745 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNC5DQ6UXZ4 953 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00696Q6ZRV3 163 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00523Q86TU6 105 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR52K1Q8NGK4 314 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2L8Q8NGY9 312 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP61Q8NHU2 1237 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC1Q99614 292 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRB3Q9BUF7 120 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSSK1BQ9BXA7 367 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLAHQ9NV23 265 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa12.6□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEATR9A2RTY3 570 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCCD1A6NED2 376 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VSTM2BA6NLU5 285 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASGRF2O14827 1237 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPC4O75487 556 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOT2P00505 430 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPP00738 406 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTMAP06454 111 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STSP08842 583 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRF1P14222 555 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CARSP49589 748 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDH17Q12864 832 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SF1Q15637 639 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLRP9Q7RTR0 991 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FJX1Q86VR8 437 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DTWD1Q8N5C7 304 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCORP1Q8N888 145 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAAF3Q8N9W5 541 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF214Q8ND24 703 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASZ1Q8WWH4 475 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC10Q969S8 669 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MESP1Q9BRJ9 268 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METRNQ9UJH8 293 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC39A10Q9ULF5 831 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAU2Q9Y6X3 613 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM169AQ9Y6X4 670 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GUH1 482 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS44E7EML9 344 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP2K7O14733 419 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL18O94889 574 aa12.59□□□□□ -0.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FKBP9O95302 570 aa12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms