RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 TEAD1P28347 426 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 YBX1P67809 324 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SGCGQ13326 291 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 DOC2AQ14183 400 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA0040Q15053 153 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM259Q4ZIN3 620 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 EYSQ5T1H1 3165 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF175Q8N4F7 328 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC58Q96CX6 371 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 GID8Q9NWU2 228 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PCM1Q15154 2024 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 BAG2O95816 211 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 NFYCQ13952 458 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PTGR1Q14914 329 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FRG2Q64ET8 278 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 RNF111Q6ZNA4 994 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 LIX1Q8N485 282 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 OXR1Q8N573 874 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FRG2BQ96QU4 278 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ASIC5Q9NY37 505 aa20.94■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 JAK1P23458 1154 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBPL1P62380 186 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PDZD3Q86UT5 571 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ASB9Q96DX5 294 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHAC1Q9H158 963 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ABCD2Q9UBJ2 740 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SERTM1A2A2V5 107 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 H3BNX3 289 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 NME4O00746 187 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PRPH2P23942 346 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 IGFALSP35858 605 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 VHLP40337 213 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 RPA4Q13156 261 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CACHD1Q5VU97 1274 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PRMT9Q6P2P2 845 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 UNC5DQ6UXZ4 953 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PHC3Q8NDX5 983 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR20Q8TBZ3 569 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 DNASE1L2Q92874 299 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ASF1AQ9Y294 204 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3EA0A087X179 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3LB9A6J9 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FUCA1P04066 466 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3HP0C7X1 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 VARSP26640 1264 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 DGKQP52824 942 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FOXM1Q08050 763 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDH1Q08174 1060 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 HORMAD1Q86X24 394 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC15A3Q8IY34 581 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FZD3Q9NPG1 666 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CD93Q9NPY3 652 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLAMF8Q9P0V8 285 aa20.92■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CROCCQ5TZA2 2017 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 KMOO15229 486 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 ASGR2P07307 311 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC6A2P23975 617 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CASP2P42575 452 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP2CBP62714 309 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP2CAP67775 309 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM124AQ86V42 546 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP5-204ENST00000412806 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms