RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 DPH1Q9BZG8 443 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 OR6C2Q9NZP2 312 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ACOT9Q9Y305 439 aa20.12■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 A0A096LPK6 155 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 BTN3A1O00481 513 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MATN4O95460 622 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TSPAN12O95859 305 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 C2P06681 752 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KRT15P19012 456 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SLC26A3P40879 764 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CCNFP41002 786 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MAGEA12P43365 314 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SLC41A2Q96JW4 573 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CABS1Q96KC9 395 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RUFY1Q96T51 708 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 VPS11Q9H270 941 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 XKR8Q9H6D3 395 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 EURLQ9NYK6 297 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 LGALS13Q9UHV8 139 aa20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PIPSLA2A3N6 862 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 BTN3A3O00478 584 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MT-ND3P03897 115 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CATP04040 527 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 C8GP07360 202 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC166P0CW27 439 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 LIPCP11150 499 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CDH3P22223 829 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PKLRP30613 574 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CSRP3P50461 194 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RAB28P51157 221 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 FOXM1Q08050 763 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SP140Q13342 867 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 BROXQ5VW32 411 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ANKS6Q68DC2 871 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 HDXQ7Z353 690 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SPACA3Q8IXA5 215 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD49Q8WVL7 239 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD7Q92527 254 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 DERL2Q9GZP9 239 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 C1GALT1Q9NS00 363 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa20.1■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 STMND1H3BQB6 276 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SLC16A5O15375 505 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MAP3K7O43318 606 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ATP6V0D1P61421 351 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 HSD11B2P80365 405 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CSHL1Q14406 222 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 IL11RAQ14626 422 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TMTC4Q5T4D3 741 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 MZB1Q8WU39 189 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ASB11Q8WXH4 323 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PMEPA1Q969W9 287 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RAD51AP1Q96B01 352 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TSNARE1Q96NA8 513 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CACNA1BQ00975 2339 aa20.09■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PKD1L2Q7Z442 2459 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KLK10O43240 276 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ZBTB14O43829 449 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 RFPL1O75677 317 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 C1orf105O95561 183 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 CYP2A7P20853 494 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 BDKRB1P46663 353 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 UCNP55089 124 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 ACY1Q03154 408 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 TUBB3Q13509 450 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 KIR2DS3Q14952 304 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.08■□□□□ 0.81
C4orf48-201ENST00000409248 SPESP1Q6UW49 350 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms