RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 IGSF5Q9NSI5 407 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ARL15Q9NXU5 204 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A0J9YY10 115 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1W2PPV9 198 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 A8MU76 341 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PLD2O14939 933 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 RFPL1O75677 317 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ANXA5P08758 320 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 NELFEP18615 380 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TFEBP19484 476 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCND1P24385 295 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HNMTP50135 292 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 IRF9Q00978 393 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 NAA25Q14CX7 972 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 RTP5Q14D33 572 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ACAP2Q15057 778 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TGFBIQ15582 683 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CLEC14AQ86T13 490 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ISCA2Q86U28 154 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LCA5Q86VQ0 697 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 KCTD4Q8WVF5 259 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PTERQ96BW5 349 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 NXNL1Q96CM4 212 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM109Q9BVC6 243 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 VPS11Q9H270 941 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TBK1Q9UHD2 729 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SATB2Q9UPW6 733 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 BTRCQ9Y297 605 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 KERAO60938 352 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SPINK2P20155 84 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SLCO1A2P46721 670 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LSSP48449 732 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TBPL1P62380 186 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HSD11B2P80365 405 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 FOXK2Q01167 660 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 OR4D1Q15615 310 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 MARCH9Q86YJ5 346 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PDPRQ8NCN5 879 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 NXPE2Q96DL1 559 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 PLAAQ9Y263 795 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 KLK4Q9Y5K2 254 aa14.71□□□□□ -0.05
ACTBP8-201ENST00000403258 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 SYCE1LA8MT33 242 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 B4E171 279 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 DXOO77932 396 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 CCNDBP1O95273 360 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 GUCA1CO95843 209 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 MSL3P1P0C860 447 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 JMJD7P0C870 316 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 ST6GAL1P15907 406 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 PSMB5P28074 263 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 CMPK1P30085 196 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 GMPRP36959 345 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 TSPAN7P41732 249 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 GPSM1Q86YR5 675 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 LSMEM2Q8N112 164 aa14.7□□□□□ -0.06
ACTBP8-201ENST00000403258 D2HGDHQ8N465 521 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms