RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384105.1

RNU6V-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear variant sequence with SNRPE pseudogene sequence, humanhuman

BASIC

Gene RNU6V, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6V-201ENST00000384105 SPAM1P38567 509 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PNPLA4P41247 253 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CDKN1BP46527 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CSNK1DP48730 415 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 KHKP50053 298 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CDH11P55287 796 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CLDN2P57739 230 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MLF1P58340 268 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PFN3P60673 137 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MT1HP80294 61 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PRKCZQ05513 592 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF543Q08ER8 600 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 FUT7Q11130 342 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PLA2G7Q13093 441 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 DNAJC3Q13217 504 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SS18Q15532 418 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TPSAB1Q15661 275 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 BTBD16Q32M84 506 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 GARNL3Q5VVW2 1013 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PPP4R4Q6NUP7 873 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 NFRKBQ6P4R8 1299 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TSSK4Q6SA08 328 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PAMR1Q6UXH9 720 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 C19orf35Q6ZS72 473 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 Q75L30 129 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 NAA40Q86UY6 237 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 COMTD1Q86VU5 262 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 RNF130Q86XS8 419 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 GATAD2AQ86YP4 633 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TMEM139Q8IV31 216 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 UNC5CLQ8IV45 518 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 OR4N5Q8IXE1 308 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SLC35F3Q8IY50 421 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 APCDD1Q8J025 514 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TMEM61Q8N0U2 210 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 BEST3Q8N1M1 668 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CPXM2Q8N436 756 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 GBGT1Q8N5D6 347 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CCDC33Q8N5R6 958 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PAF1Q8N7H5 531 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 NAT8LQ8N9F0 302 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 FSIP1Q8NA03 581 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TEX19Q8NA77 164 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 Q8NFD4 153 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 OR2L5Q8NG80 312 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 OR4C3Q8NH37 302 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 C11orf45Q8TAV5 145 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SPPL3Q8TCT6 385 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 RAET1EQ8TD07 263 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MCOLN3Q8TDD5 553 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SLC44A1Q8WWI5 657 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SMPDL3BQ92485 455 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 FGF11Q92914 225 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TMEM106AQ96A25 262 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SH3KBP1Q96B97 665 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 DPH3Q96FX2 82 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 GRAMD2BQ96HH9 432 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CCDC34Q96HJ3 373 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SIN3AQ96ST3 1273 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MAP3K3Q99759 626 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 UBAC1Q9BSL1 405 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 SHARPINQ9H0F6 387 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 CXXC4Q9H2H0 198 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 LIME1Q9H400 295 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TSPY26PQ9H489 355 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 C11orf49Q9H6J7 331 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 C10orf95Q9H7T3 257 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6V-201ENST00000384105 MAGEE1Q9HCI5 957 aa-0.03□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms