RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 NOBOXO60393 691 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGEF7Q14155 803 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 MEP1AQ16819 746 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CATSPEREQ5SY80 951 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NECAB2Q7Z6G3 386 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 THAP5Q7Z6K1 395 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ELMOD1Q8N336 334 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 WFDC5Q8TCV5 224 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TXNDC15Q96J42 360 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 OR52E6Q96RD3 313 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 IKZF5Q9H5V7 419 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GORASP2Q9H8Y8 452 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 LRTM1Q9HBL6 345 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 INVSQ9Y283 1065 aa12.87□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ELOVL7A1L3X0 281 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 M0R3G1 203 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RGS13O14921 159 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PGRP06401 933 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 AGXTP21549 392 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CD40LGP29965 261 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 AP1S1P61966 158 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SEMG2Q02383 582 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GPNMBQ14956 572 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ADPRMQ3LIE5 342 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PPP2R2DQ66LE6 453 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF783Q6ZMS7 281 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GALNT13Q8IUC8 556 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PHACTR4Q8IZ21 702 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RGL4Q8IZJ4 473 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF555Q8NEP9 628 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PSMA8Q8TAA3 256 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 RHBDF1Q96CC6 855 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CLSTN3Q9BQT9 956 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ACTR8Q9H981 624 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO8Q9NRD0 319 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 UTS2RQ9UKP6 389 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ARVCFO00192 962 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 MANBAO00462 879 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CXCR6O00574 342 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HOXA2O43364 376 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PRKD3O94806 890 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PRSS23O95084 383 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 IL6P05231 212 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 EPB42P16452 691 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NAT1P18440 290 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ACRV1P26436 265 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HNF1BP35680 557 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 COPZ1P61923 177 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CHRNA6Q15825 494 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NKG7Q16617 165 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TCTN1Q2MV58 587 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ADCK1Q86TW2 530 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 APCDD1Q8J025 514 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GLMNQ92990 594 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CEP295NLQ96MC4 621 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SH3GL1Q99961 368 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HPS4Q9NQG7 708 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ABCB10Q9NRK6 738 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 DNAJB9Q9UBS3 223 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PDE10AQ9Y233 779 aa12.86□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ZBBXA8MT70 800 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SNPHO15079 494 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ASNA1O43681 348 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 NDUFS2O75306 463 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 BPIP17213 487 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 VBP1P61758 197 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GTDC1Q4AE62 458 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 TTC23Q5W5X9 447 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SPESP1Q6UW49 350 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC115Q96NT0 180 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SLC22A12Q96S37 553 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 ABCG8Q9H221 673 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 OR51B4Q9Y5P0 310 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 C16orf96A6NNT2 1141 aa12.85□□□□□ -0.35
TMOD1-202ENST00000375175 PTGES3LE9PB15 166 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms