RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375135.3

FGD1-201, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FGD1, Length 4,275 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1-201ENST00000375135 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 EPOP01588 193 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 NR2F1P10589 423 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 GABRB3P28472 473 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 NUDT6P53370 316 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 FBXW4P57775 412 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ZNF773Q6PK81 442 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PIANPQ8IYJ0 282 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 HS3ST5Q8IZT8 346 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 STON2Q8WXE9 905 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PTERQ96BW5 349 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 FAM234BA2RU67 622 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 BMP10O95393 424 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ADH1CP00326 375 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CYP11A1P05108 521 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CD36P16671 472 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 COPZ1P61923 177 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PLEKHG6Q3KR16 790 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CNIH3Q8TBE1 160 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ZNF597Q96LX8 424 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CMTM6Q9NX76 183 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 GMEB1Q9Y692 573 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 H3BMQ9 156 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TYRP14679 529 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 HNF1BP35680 557 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 NFATC3Q12968 1075 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 RFX4Q33E94 735 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 C6orf136Q5SQH8 315 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DEF8Q6ZN54 512 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 SYVN1Q86TM6 617 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 COG8Q96MW5 612 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TESMINQ9Y4I5 508 aa15.01□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TEX28O15482 410 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TULP3O75386 442 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 OPN1SWP03999 348 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CDH1P12830 882 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 C1DQ13901 141 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CASP12Q6UXS9 341 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 GDPD4Q6W3E5 623 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TSPAN33Q86UF1 283 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 C17orf64Q86WR6 236 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CLIP3Q96DZ5 547 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DERL2Q9GZP9 239 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TNFRSF21O75509 655 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 SOD2P04179 222 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 RFC2P35250 354 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 SSR2P43308 183 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PLA2G16P53816 162 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CEP78Q5JTW2 689 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 LSMEM2Q8N112 164 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 C8orf4Q9NR00 106 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 FAIMQ9NVQ4 179 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PIPSLA2A3N6 862 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DFNA5O60443 496 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ALOX5P09917 674 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 SEC13P55735 322 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 DNAJB13P59910 316 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PHKG1Q16816 387 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 C2orf27AQ580R0 203 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ZUFSPQ96AP4 578 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 TDP1Q9NUW8 608 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 AASSQ9UDR5 926 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 FUOMA2VDF0 154 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ABCB7O75027 752 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 SLC6A4P31645 630 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 MAGEA3P43357 314 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 MAP2K4P45985 399 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ACADVLP49748 655 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 ALDH3A2P51648 485 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 RING1Q06587 406 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 LMAN2Q12907 356 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 HKDC1Q2TB90 917 aa15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
FGD1-201ENST00000375135 OR14C36Q8NHC7 312 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms