RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 PIK3R3Q92569 461 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 DPF3Q92784 378 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 YIPF6Q96EC8 236 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MOCOSQ96EN8 888 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MED30Q96HR3 178 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF599Q96NL3 588 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB18Q99592 522 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 APOL2Q9BQE5 337 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 C17orf80Q9BSJ5 609 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC32Q9BV29 185 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 FICDQ9BVA6 458 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NACA2Q9H009 215 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 DUSP21Q9H596 190 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NTN4Q9HB63 628 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 PIGVQ9NUD9 493 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 OSGIN1Q9UJX0 560 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SCN1AP35498 2009 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 HTTP42858 3142 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TTC34A8MYJ7 566 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 UPK1AO00322 258 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 BCKDKO14874 412 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TMPRSS2O15393 492 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 GPR39O43194 453 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 RGS10O43665 173 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NBNO60934 754 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 KERAO60938 352 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ACVR2AP27037 513 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 LHX1P48742 406 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SUOXP51687 545 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK10P53779 464 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MLLT10P55197 1068 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 OLR1P78380 273 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ID3Q02535 119 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CD47Q08722 323 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM60Q495X7 471 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP6Q5VW22 663 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 RANBP10Q6VN20 620 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 LYSMD2Q8IV50 215 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC103Q8IW40 242 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD6LQ8IWD5 586 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NXPE1Q8N323 547 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ARL10Q8N8L6 244 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 POC5Q8NA72 575 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 PSMA8Q8TAA3 256 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 LPPQ93052 612 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 RMDN1Q96DB5 314 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TMCO6Q96DC7 493 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 LGALS12Q96DT0 336 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 AGAP4Q96P64 663 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 WDCPQ9H6R7 721 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ALG9Q9H6U8 611 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 ACSS2Q9NR19 701 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 OR12D3Q9UGF7 316 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 DSEQ9UL01 958 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 TBX21Q9UL17 535 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 CDH9Q9ULB4 789 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 BTRCQ9Y297 605 aa7.03□□□□□ -1.28
CTPS1-201ENST00000372616 NOX1Q9Y5S8 564 aa7.03□□□□□ -1.28
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