RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CTAGE4Q8IX94 777 aa26■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 SLC38A9Q8NBW4 561 aa26■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 MCMBPQ9BTE3 642 aa26■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 IL17BQ9UHF5 180 aa26■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.98■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF480Q8WV37 535 aa25.98■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 SLC22A18Q96BI1 424 aa25.98■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa25.97■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 CROTQ9UKG9 612 aa25.97■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 ITPR1Q14643 2758 aa25.97■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 FAM159BA6NKW6 160 aa25.96■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 PNLIPRP1P54315 467 aa25.96■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 TAS2R39P59534 338 aa25.96■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa25.96■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 OR2L3Q8NG85 312 aa25.96■■□□□ 1.75
TPGS1-201ENST00000359315 OR8K5Q8NH50 307 aa25.96■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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TPGS1-201ENST00000359315 ZBTB14O43829 449 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
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TPGS1-201ENST00000359315 ECHS1P30084 290 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 RGS4P49798 205 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 LCN10Q6JVE6 187 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 MYO1HQ8N1T3 1032 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 LRRN4CLQ8ND94 238 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 CT55Q8WUE5 264 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 SYTL2Q9HCH5 934 aa25.95■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 E7ENX8 843 aa25.94■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 MAP3K7O43318 606 aa25.94■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 CYP2A7P20853 494 aa25.94■■□□□ 1.74
TPGS1-201ENST00000359315 DLSTP36957 453 aa25.94■■□□□ 1.74
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