RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC90BQ9GZT6 254 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SNX6Q9UNH7 406 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CLDN25C9JDP6 229 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 XYLBO75191 536 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 GABARAPO95166 117 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SELPP16109 830 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 EPORP19235 508 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BCAP31P51572 246 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 RAPSNQ13702 412 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF846Q147U1 533 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TAF12Q16514 161 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ELMOD1Q8N336 334 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 INPP5KQ9BT40 448 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ELOVL6Q9H5J4 265 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 HMG20AQ9NP66 347 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ARL15Q9NXU5 204 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL42Q9P2K6 505 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 ERVW-1Q9UQF0 538 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TMED5Q9Y3A6 229 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BACE2Q9Y5Z0 518 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 DGKBQ9Y6T7 804 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 SEC24AO95486 1093 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 FUCA1P04066 466 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 OPRL1P41146 370 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 NSG1P42857 185 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 KEAP1Q14145 624 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TCAIMQ8N3R3 496 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 DBF4BQ8NFT6 615 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 CNIH3Q8TBE1 160 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 FAR1Q8WVX9 515 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 VNN3Q9NY84 501 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-201ENST00000355530 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC22A1O15245 554 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NBNO60934 754 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 GSNP06396 782 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ACPPP15309 386 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SDC1P18827 310 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 RPIAP49247 311 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGDIAP52565 204 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 RELAQ04206 551 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINA11Q86U17 422 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ANKRD46Q86W74 232 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 KLHL23Q8NBE8 558 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 WFDC5Q8TCV5 224 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 MCOLN3Q8TDD5 553 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TSSK3Q96PN8 268 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 EXD2Q9NVH0 621 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PPT2Q9UMR5 302 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TPRKBQ9Y3C4 175 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TBKBP1A7MCY6 615 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 AGAP14A8MT82 685 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NPIPB8E9PQR5 432 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 RFXANKO14593 260 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 JUNDP17535 347 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 IDUAP35475 653 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CDKN2CP42773 168 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PPP3CCP48454 512 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 CSNK1DP48730 415 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ITGADQ13349 1161 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PGS1Q32NB8 556 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 OR2T5Q6IEZ7 315 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM74Q86UV6 250 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM73Q86UV7 250 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SLC43A3Q8NBI5 491 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 OR7A2PQ8NGA2 310 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 OR2T29Q8NH02 315 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 RORBQ92753 470 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NELL1Q92832 810 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 HHIPQ96QV1 700 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 TM9SF3Q9HD45 589 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 XPNPEP2O43895 674 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF682O95780 498 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 FTH1P02794 183 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 UGT2B4P06133 528 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-201ENST00000355530 NR4A1P22736 598 aa17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms