RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TPK1Q9H3S4 243 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 CD274Q9NZQ7 290 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 IL36AQ9UHA7 158 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 C2orf16Q68DN1 1984 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 AZIN1O14977 448 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 SNX2O60749 519 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ALBP02768 609 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TIMP2P16035 220 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 LCP2Q13094 533 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF7Q14155 803 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB2Q8N680 514 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF366Q8N895 744 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 FGF13Q92913 245 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 HPS4Q9NQG7 708 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PCTPQ9UKL6 214 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 NFATC1O95644 943 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 LDLRP01130 860 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF30P17039 623 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 NSG1P42857 185 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 SLC6A11P48066 632 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 RGS4P49798 205 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 FOXA1P55317 472 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 B4GALNT1Q00973 533 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 MESP2Q0VG99 397 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 EPS8Q12929 822 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PPP1R3AQ16821 1122 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 GAB4Q2WGN9 574 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 KANK2Q63ZY3 851 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.52e-6■■□□□ 11.8
SPNS1-204ENST00000352260 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 NXPE3Q969Y0 559 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ULK4Q96C45 1275 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 COPS8Q99627 209 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 BDH2Q9BUT1 245 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 APOL5Q9BWW9 433 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PCDH12Q9NPG4 1184 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ELOVL2Q9NXB9 296 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 CD84Q9UIB8 345 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 EPOPA6NHQ4 379 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 HEPACAM2A8MVW5 462 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 GPX3P22352 226 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 DGKAP23743 735 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 NFKBIAP25963 317 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 CDC20Q12834 499 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 SBSNQ6UWP8 590 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 OFCC1Q8IZS5 231 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 FKBP10Q96AY3 582 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 C19orf60Q96EN9 201 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 KCNA7Q96RP8 456 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 LHPPQ9H008 270 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ABCG8Q9H221 673 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 CPNE5Q9HCH3 593 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 DZANK1Q9NVP4 752 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ANAPC2Q9UJX6 822 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GTL3 188 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ARPC2O15144 300 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 UGT2B11O75310 529 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 MATN4O95460 622 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 HPRP00739 348 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 MLLT10P55197 1068 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ST8SIA6P61647 398 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF805Q5CZA5 627 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 LACC1Q8IV20 430 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TWIST2Q8WVJ9 160 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 HPS1Q92902 700 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 LRIG1Q96JA1 1093 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 C3orf30Q96M34 536 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 DKK3Q9UBP4 350 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 ASB1Q9Y576 335 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 TCRBV5S2A0A599 114 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 PRRT4C9JH25 899 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 SLC22A1O15245 554 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS1-204ENST00000352260 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms