RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CALML5Q9NZT1 146 aa20.26■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 MORN1Q5T089 497 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 C17orf99Q6UX52 265 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 TPK1Q9H3S4 243 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 SPATA2Q9UM82 520 aa20.25■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.25■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 MMP20O60882 483 aa20.25■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 SLC9A5Q14940 896 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PRR23BQ6ZRT6 265 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 BEND5Q7L4P6 421 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.24■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.24■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 CASKO14936 926 aa20.24■□□□□ 0.83
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NISCH-201ENST00000345716 Q6ZVL8 140 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 LRRTM3Q86VH5 581 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.24■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 IL12AP29459 219 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 TRPV3Q8NET8 790 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 SLC35A5Q9BS91 424 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PFKMP08237 780 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 CADM2Q8N3J6 435 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 PACRGLQ8N7B6 248 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
NISCH-201ENST00000345716 STC2O76061 302 aa20.23■□□□□ 0.83
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