RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 REM1O75628 298 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CCL5P13501 91 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 IL1R2P27930 398 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 GRM2Q14416 872 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ADGRF1Q5T601 910 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PIM3Q86V86 326 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 UFD1Q92890 307 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MGME1Q9BQP7 344 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CNTN3Q9P232 1028 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MRC1P22897 1456 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ERI3O43414 337 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 FCRL5Q96RD9 977 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 EBF4Q9BQW3 602 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RIMKLBQ9ULI2 386 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CLDN7O95471 211 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PRAMEF12O95522 483 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 P4HA3Q7Z4N8 544 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CREB5Q02930 508 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TEAD2Q15562 447 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 KCNC2Q96PR1 638 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 MIPEPQ99797 713 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 COQ10BQ9H8M1 238 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CREB1P16220 341 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 CXCR1P25024 350 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF627Q7L945 461 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 RAB43Q86YS6 212 aa21.89■■□□□ 1.1
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM63AO94886 807 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SNX4O95219 450 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 NUDT13Q86X67 352 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PDE10AQ9Y233 779 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 FAM234BA2RU67 622 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PITPNM1O00562 1244 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 INMTO95050 263 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SLC6A9P48067 706 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 NRIP1P48552 1158 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 UAP1L1Q3KQV9 507 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CRELD1Q96HD1 420 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 HS3ST4Q9Y661 456 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CCNKO75909 580 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 GDI2P50395 445 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CNKSR3Q6P9H4 555 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 RGMAQ96B86 450 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 MED28Q9H204 178 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 FZD4Q9ULV1 537 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ASB3Q9Y575 518 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF726A6NNF4 738 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 PCDHAC1Q9H158 963 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ITM2AO43736 263 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 OPN1SWP03999 348 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 AGXTP21549 392 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CASRP41180 1078 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 AQP4P55087 323 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CYP27C1Q4G0S4 372 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SUN3Q8TAQ9 357 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 LMX1AQ8TE12 382 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SUSD3Q96L08 255 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 LGR4Q9BXB1 951 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SNTG1Q9NSN8 517 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 FBXL12Q9NXK8 326 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A14Q9Y267 594 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 TULP2O00295 520 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF20P17024 532 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 VIPR1P32241 457 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 B3GNT4Q9C0J1 378 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 INSL6Q9Y581 213 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 OR4E2Q8NGC2 313 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS3O15072 1205 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 MLIPQ5VWP3 458 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF347Q96SE7 839 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 MINDY3Q9H8M7 445 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 GRHL1Q9NZI5 618 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 H3BSH0 61 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 INPPL1O15357 1258 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 GATMP50440 423 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 OLIG2Q13516 323 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 ADNP2Q6IQ32 1131 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 LRRTM4Q86VH4 590 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRM-201ENST00000332175 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms