RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299259.10

COPS2-201, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene COPS2, Length 2,036 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2-201ENST00000299259 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 RAD51AP1Q96B01 352 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 FRG2BQ96QU4 278 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ACPTQ9BZG2 426 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 LRTM1Q9HBL6 345 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TMEM45AQ9NWC5 275 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ZIM2Q9NZV7 527 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 MOSPD1Q9UJG1 213 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ACSL5Q9ULC5 683 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CA14Q9ULX7 337 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 C9JVG2 144 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 FPGTO14772 594 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SLC22A3O75751 556 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SLC2A4P14672 509 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 IL9P15248 144 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 GNAZP19086 355 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CD22P20273 847 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CAPN3P20807 821 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 KELP23276 732 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CLCNKAP51800 687 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 DGKEP52429 567 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PNLIPRP1P54315 467 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 MTTPP55157 894 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 KCNK10P57789 538 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 LRRC32Q14392 662 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TMEM31Q5JXX7 168 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PGM2L1Q6PCE3 622 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CYP20A1Q6UW02 462 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 Q7L0L9 218 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PGBD3Q8N328 593 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 FBXW8Q8N3Y1 598 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 OR5K2Q8NHB8 316 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 STMN2Q93045 179 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SERPINI1Q99574 410 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SGPP1Q9BX95 441 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SGK2Q9HBY8 427 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 C1orf109Q9NX04 203 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SUFUQ9UMX1 484 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 KCNK6Q9Y257 313 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 KCNE2Q9Y6J6 123 aa10.19□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CROCCQ5TZA2 2017 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 POM121BA6NF01 834 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SEMA4FO95754 770 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 FUCA1P04066 466 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CHRNB1P11230 501 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 HNF4AP41235 474 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 GNPDA1P46926 289 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CLDN2P57739 230 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 UFM1P61960 85 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ZNF33BQ06732 778 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PCDH1Q08174 1060 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 LRP8Q14114 963 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 DOC2AQ14183 400 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 NFATC4Q14934 902 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PYCR3Q53H96 274 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 COQ5Q5HYK3 327 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 IL23RQ5VWK5 629 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 HACD2Q6Y1H2 254 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ZFAND4Q86XD8 727 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TSPEARQ8WU66 669 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 NEIL2Q969S2 332 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ROPN1LQ96C74 230 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SPDL1Q96EA4 605 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 FGF22Q9HCT0 170 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 ASIC5Q9NY37 505 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 PRSS38A1L453 326 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 FAM234BA2RU67 622 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 E7ENX8 843 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 CFLARO15519 480 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 LATO43561 262 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 KCNJ13O60928 360 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 SEC22BO75396 215 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 IGLV3-19P01714 112 aa10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 LMNAP02545 664 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
COPS2-201ENST00000299259 G6PDP11413 515 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms