RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 KCTD3Q9Y597 815 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PEX12O00623 359 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TBX18O95935 607 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 S1PR4O95977 384 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RLN1P04808 185 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 THRBP10828 461 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RPL34P49207 117 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 XKR4Q5GH76 650 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 THAP5Q7Z6K1 395 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CPNE9Q8IYJ1 553 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RHEBL1Q8TAI7 183 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 HCAR2Q8TDS4 363 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 IPPKQ9H8X2 491 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ADGRE2Q9UHX3 823 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TBC1D24Q9ULP9 559 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SIPA1L1O43166 1804 aa12.06□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MAGEA12P43365 314 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GSK3BP49841 420 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MAPK10P53779 464 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MYBPC1Q00872 1141 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SERINC3Q13530 473 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MAVSQ7Z434 540 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SCML4Q8N228 414 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CXCL16Q9H2A7 254 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MIOSQ9NXC5 875 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SSR3Q9UNL2 185 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 EI24O14681 340 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CNTN5O94779 1100 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NCK1P16333 377 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 AKT2P31751 481 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MS4A2Q01362 244 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 LSAMPQ13449 338 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MYO19Q96H55 970 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OAZ3Q9UMX2 235 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 H3BSA7 217 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CLDN4O14493 209 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RB1P06400 928 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SPATA31D3P0C874 917 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CTPS1P17812 591 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ITPKBP27987 946 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RPL4P36578 427 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RPL3P39023 403 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ZBED5Q49AG3 693 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 FAM151BQ6UXP7 276 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 HID1Q8IV36 788 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GOLM1Q8NBJ4 401 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SLC47A1Q96FL8 570 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ERVK-11Q9UQG0 969 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PRAMEF11O60813 436 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 REM1O75628 298 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 C1RP00736 705 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PENKP01210 267 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CYP11A1P05108 521 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 TFPIP10646 304 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ACVRL1P37023 503 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MTHFRP42898 656 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GALK1P51570 392 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PRKAG1P54619 331 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OLR1P78380 273 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC32Q14392 662 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 UNC50Q53HI1 259 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 RIT1Q92963 219 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SLC45A3Q96JT2 553 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 LMAN2LQ9H0V9 348 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 IGSF5Q9NSI5 407 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MLXQ9UH92 298 aa12.05□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MEIS3P2A8K0S8 358 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PER2O15055 1255 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MT-ND1P03886 318 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 ASLP04424 464 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 CD1DP15813 335 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 PCSK2P16519 638 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 MAGEA11P43364 429 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GTF2H2Q13888 395 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 GPR180Q86V85 440 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SYT12Q8IV01 421 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 SPAG16Q8N0X2 631 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 OR5T3Q8NGG3 340 aa12.04□□□□□ -0.48
PTPRG-201ENST00000295874 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms