RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 KDELC1Q6UW63 502 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 UNC5AQ6ZN44 842 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 VSIG1Q86XK7 387 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 OLFM3Q96PB7 478 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SPSB2Q99619 263 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 COPS8Q99627 209 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 COG4Q9H9E3 785 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 EURLQ9NYK6 297 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 OR6C2Q9NZP2 312 aa11.5□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NUP210LQ5VU65 1888 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CTAGE15A4D2H0 777 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 DSCR3O14972 297 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 KDM1AO60341 852 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NADKO95544 446 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CTAGE8P0CG41 777 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FDXRP22570 491 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PTPN3P26045 913 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PDHA2P29803 388 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TLE4Q04727 773 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FAAH2Q6GMR7 532 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 HDXQ7Z353 690 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CTAGE6Q86UF2 777 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 OR4K2Q8NGD2 314 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ZNF160Q9HCG1 818 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PTGFRNQ9P2B2 879 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 POLG2Q9UHN1 485 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ICKQ9UPZ9 632 aa11.49□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 C5orf60A6NFR6 353 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ISM1B1AKI9 464 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SLC19A2O60779 497 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 GSTM1P09488 218 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ACPPP15309 386 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NFKB1P19838 968 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MST1P26927 711 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CD68P34810 354 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 KIR3DL1P43629 444 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 GSTM4Q03013 218 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MPP3Q13368 585 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PTPRCAPQ14761 206 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS3Q14952 304 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ODF2Q5BJF6 829 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NPNTQ6UXI9 565 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 IPMKQ8NFU5 416 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FCRL5Q96RD9 977 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CRB3Q9BUF7 120 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FSD1LQ9BXM9 530 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PARD6BQ9BYG5 372 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 GPAMQ9HCL2 828 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 CUTCQ9NTM9 273 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SPHK1Q9NYA1 384 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FKBPLQ9UIM3 349 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ASF1AQ9Y294 204 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ARL5AQ9Y689 179 aa11.48□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 AGAP14A8MT82 685 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 C19orf84I3L1E1 186 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 WFS1O76024 890 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PRR35P0CG20 571 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ITGALP20701 1170 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 SOX11P35716 441 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NSG1P42857 185 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 GCGRP47871 477 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 NR2C2P49116 596 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 RAB28P51157 221 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ADORA2A-AS1P86434 159 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 OCA2Q04671 838 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 GRM7Q14831 915 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TCTE1Q5JU00 501 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 PID1Q7Z2X4 250 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 RFX6Q8HWS3 928 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 OR5AR1Q8NGP9 310 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MAGED4Q96JG8 741 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 VAT1Q99536 393 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 FUT8Q9BYC5 575 aa11.47□□□□□ -0.57
SPC25-201ENST00000282074 MED4Q9NPJ6 270 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.2 ms