RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 LINGO4Q6UY18 593 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SERPINA9Q86WD7 417 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SCAIQ8N9R8 606 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ACPTQ9BZG2 426 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DSN1Q9H410 356 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RMND5AQ9H871 391 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 IL1RAPQ9NPH3 570 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 OSGIN1Q9UJX0 560 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF232Q9UNY5 417 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ILVBLA1L0T0 632 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZBBXA8MT70 800 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 FAM20BO75063 409 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DIRAS1O95057 198 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CCNDBP1O95273 360 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 VNN2O95498 520 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 C1QCP02747 245 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CLDN8P56748 225 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SVOPQ8N4V2 548 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RHOXF1Q8NHV9 184 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PYCR2Q96C36 320 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ULK4Q96C45 1275 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 APOL4Q9BPW4 351 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CORO1BQ9BR76 489 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TM9SF3Q9HD45 589 aa14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MTMR11A4FU01 709 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 H0Y626 953 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CLDN11O75508 207 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MYO1DO94832 1006 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TRIM16O95361 564 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CTPS1P17812 591 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ARHGDIAP52565 204 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PPP5CP53041 499 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MVKQ03426 396 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TWF1Q12792 350 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DOK6Q6PKX4 331 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CERS6Q6ZMG9 384 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DENND1CQ8IV53 801 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 UBE2FQ969M7 185 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PARVBQ9HBI1 364 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GPRC5BQ9NZH0 403 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PPT2Q9UMR5 302 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 OR2A25A4D2G3 310 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 hCG_2039718K7EN88 272 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SYN3O14994 580 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 NTRK1P04629 796 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 LCKP06239 509 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ALPIP09923 528 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 EPB42P16452 691 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 CD36P16671 472 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DGKAP23743 735 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KRT20P35900 424 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 HMGCLP35914 325 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SLC11A2P49281 568 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 FADDQ13158 208 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 KCNJ8Q15842 424 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SAPCD2Q86UD0 394 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SPATA17Q96L03 361 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 LAMA3Q16787 3333 aa14.54□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PRAMEF1O95521 474 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 PDYNP01213 254 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 TACR1P25103 407 aa14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
SYP-201ENST00000263233 SELENBP1Q13228 472 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms