RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261464.9

TRAF5-201, Transcript of TNF receptor associated factor 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF5, Length 3,972 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF5-201ENST00000261464 IFNA16P05015 189 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 HOXB2P14652 356 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ARSAP15289 507 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 FDXRP22570 491 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KELP23276 732 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ITGB8P26012 769 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IRS1P35568 1242 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SPINT3P49223 89 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 HTR6P50406 440 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 LSM3P62310 102 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GRIN2CQ14957 1233 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PHKG1Q16816 387 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TRIM40Q6P9F5 258 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 STX19Q8N4C7 294 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SMARCD2Q92925 531 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PEX13Q92968 403 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GLMNQ92990 594 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GLYATL1Q969I3 302 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IL17FQ96PD4 163 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SORT1Q99523 831 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ARNT2Q9HBZ2 717 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RASSF1Q9NS23 344 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 FAM234BA2RU67 622 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RGS5O15539 181 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GRID2O43424 1007 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 FAM20BO75063 409 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CEBPBP17676 345 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ACRV1P26436 265 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GSK3BP49841 420 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CCR4P51679 360 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 AP1S2P56377 157 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 DNAJB13P59910 316 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ROPN1LQ96C74 230 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 XKR8Q9H6D3 395 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 C3orf18Q9UK00 162 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 IGLON5A6NGN9 336 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 G3V2T6 193 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 H3BQ06 376 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 SLC28A2O43868 658 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 GUCY1B2O75343 617 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 F11P03951 625 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PGRP06401 933 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KLK1P06870 262 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 PRPS2P11908 318 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 POU2F1P14859 743 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 MAGEA3P43357 314 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ANO7Q6IWH7 933 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 DEF8Q6ZN54 512 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 KRT73Q86Y46 540 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 USP7Q93009 1102 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 OTUB2Q96DC9 234 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 LMLNQ96KR4 655 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 CGREF1Q99674 301 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 DUSP26Q9BV47 211 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TRAF5-201ENST00000261464 A0A087WXM4 84 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms