RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CD300CQ08708 224 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 LINGO4Q6UY18 593 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PGBD3Q8N328 593 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB2Q8N680 514 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PRAMEF1O95521 474 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ATF6P18850 670 aa21.59■■□□□ 1.05
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HTATSF1-201ENST00000218364 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM151BQ6UXP7 276 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SVOPQ8N4V2 548 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC35B4Q969S0 331 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PLD4Q96BZ4 506 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PARVBQ9HBI1 364 aa21.59■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa21.59■■□□□ 1.05
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HTATSF1-201ENST00000218364 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.58■■□□□ 1.05
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HTATSF1-201ENST00000218364 KRT6BP04259 564 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 PRPS2P11908 318 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT6CP48668 564 aa21.58■■□□□ 1.05
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HTATSF1-201ENST00000218364 ARHGDIAP52565 204 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 ADCK1Q86TW2 530 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM9CQ8IZT9 166 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TESCQ96BS2 214 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 APOL4Q9BPW4 351 aa21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HTATSF1-201ENST00000218364 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 H0Y626 953 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM16O95361 564 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CLDN9O95484 217 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MT-ND2P03891 347 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMG1P04279 462 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 NTRK1P04629 796 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 GSNP06396 782 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf43Q9BQ61 176 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ACOT13Q9NPJ3 140 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 GMPPBQ9Y5P6 360 aa21.58■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC10A3P09131 477 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CTPS1P17812 591 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKN2CP42773 168 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNA10Q16322 511 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINA11Q86U17 422 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CLDN19Q8N6F1 224 aa21.57■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 PIH1D2Q8WWB5 315 aa21.57■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 RGS10O43665 173 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 STK16O75716 305 aa21.57■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 TMED10P49755 219 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX29P2Q8IUI4 249 aa21.57■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 PPT2Q9UMR5 302 aa21.57■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 STC2O76061 302 aa21.56■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 EPORP19235 508 aa21.56■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 PRPH2P23942 346 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH4A1P30038 563 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 FCGRTP55899 365 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKHQ9HCJ1 492 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP4B1P13584 511 aa21.56■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 HOXA9P31269 272 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2H3Q13889 308 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRF1Q5T601 910 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM236Q5W0B7 351 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC23LQ6PF05 361 aa21.56■■□□□ 1.04
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HTATSF1-201ENST00000218364 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 TTC16Q8NEE8 873 aa21.56■■□□□ 1.04
HTATSF1-201ENST00000218364 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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