RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631043.2

TCF4-275, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 510 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-275	ENST00000631043	PTPN4	P29074	926 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CRABP2	P29373	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SERPINB5	P36952	375 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NNMT	P40261	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PBX3	P40426	434 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ABCG1	P45844	678 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC1A6	P48664	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HNMT	P50135	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	AQP5	P55064	265 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ARPP19	P56211	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RAB10	P61026	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IRX4	P78413	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IRF9	Q00978	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	DSC2	Q02487	901 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ASPH	Q12797	758 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	STK11	Q15831	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TMEM177	Q53S58	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MARC1	Q5VT66	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TRIM73	Q86UV7	250 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	BBS5	Q8N3I7	341 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CALML6	Q8TD86	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	JADE3	Q92613	823 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IGSF8	Q969P0	613 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PSMG2	Q969U7	264 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TUBGCP3	Q96CW5	907 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	IGSF21	Q96ID5	467 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SORT1	Q99523	831 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TCF25	Q9BQ70	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PCED1A	Q9H1Q7	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CWH43	Q9H720	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	KCNK13	Q9HB14	408 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CRLF2	Q9HC73	371 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	NT5M	Q9NPB1	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	TBX21	Q9UL17	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TCF4-275	ENST00000631043	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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