RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 KATNAL2Q8IYT4 538 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CUTCQ9NTM9 273 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSFQ9UBX1 484 aa26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 APOC2P02655 101 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TPBGLP0DKB5 382 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CTNNA2P26232 953 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ACADLP28330 430 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCKSL1P49006 195 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ARG2P78540 354 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNG1Q06432 222 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MFAP5Q13361 173 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM14Q14142 442 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 BBS12Q6ZW61 710 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf43Q9BQ61 176 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA3GQ9NS98 782 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG6Q9Y672 507 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS21Q9Y6M0 314 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 OTOGQ6ZRI0 2925 aa26.25■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 QSOX1O00391 747 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 DSCR3O14972 297 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNN4O15554 427 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCRHP07919 91 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TPM1P09493 284 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MCM3P25205 808 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND5AQ6IQ26 1287 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 COX15Q7KZN9 410 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF7Q7Z4P5 450 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TAX1BP1Q86VP1 789 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PIANPQ8IYJ0 282 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 OR11G2Q8NGC1 345 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ALS2CR12Q96Q35 445 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CRB3Q9BUF7 120 aa26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NSG1P42857 185 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1D4P47884 311 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ART3Q13508 389 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GRM7Q14831 915 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PRSS58Q8IYP2 241 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC110Q8TBZ0 833 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC26A1Q9H2B4 701 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF160Q9HCG1 818 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.23■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SYCE3A1L190 88 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL18O94889 574 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 TPH1P17752 444 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 PKLRP30613 574 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIA3P42263 894 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GCGRP47871 477 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 Q0VFX4 171 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 GFRALQ6UXV0 394 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTL9Q8TC94 416 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 RELTQ969Z4 430 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 LMF1Q96S06 567 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM118BQ9BPY3 351 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD10Q9NUJ1 306 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CIDEBQ9UHD4 219 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MAU2Q9Y6X3 613 aa26.22■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC88CQ9P219 2028 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 DYTNA2CJ06 578 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 H7C0S8 307 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP2K7O14733 419 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB28P51157 221 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA13Q96N96 652 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SELENOSQ9BQE4 189 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 INTUQ9ULD6 942 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 APCP25054 2843 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 C2CD3Q4AC94 2353 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC5A10A0PJK1 596 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 HPP00738 406 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 OR56A5P0C7T3 313 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 COX6B1P14854 86 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ACPPP15309 386 aa26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
CAPNS1-217ENST00000629983 ITIH4Q14624 930 aa26.2■■□□□ 1.78
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